Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK7

Rnf11, RING finger protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf11Q9QYK7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf11Q9QYK7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf11Q9QYK7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf11Q9QYK7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf11Q9QYK7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf11Q9QYK7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf11Q9QYK7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf11Q9QYK7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf11Q9QYK7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf11Q9QYK7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf11Q9QYK7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf11Q9QYK7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf11Q9QYK7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf11Q9QYK7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf11Q9QYK7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf11Q9QYK7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf11Q9QYK7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf11Q9QYK7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf11Q9QYK7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf11Q9QYK7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf11Q9QYK7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf11Q9QYK7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf11Q9QYK7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf11Q9QYK7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf11Q9QYK7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf11Q9QYK7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf11Q9QYK7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf11Q9QYK7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf11Q9QYK7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf11Q9QYK7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf11Q9QYK7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf11Q9QYK7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf11Q9QYK7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf11Q9QYK7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf11Q9QYK7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf11Q9QYK7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf11Q9QYK7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf11Q9QYK7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf11Q9QYK7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf11Q9QYK7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf11Q9QYK7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf11Q9QYK7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf11Q9QYK7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf11Q9QYK7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf11Q9QYK7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf11Q9QYK7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf11Q9QYK7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf11Q9QYK7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf11Q9QYK7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf11Q9QYK7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf11Q9QYK7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf11Q9QYK7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf11Q9QYK7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf11Q9QYK7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf11Q9QYK7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf11Q9QYK7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf11Q9QYK7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf11Q9QYK7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf11Q9QYK7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf11Q9QYK7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf11Q9QYK7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf11Q9QYK7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf11Q9QYK7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf11Q9QYK7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf11Q9QYK7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf11Q9QYK7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf11Q9QYK7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf11Q9QYK7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf11Q9QYK7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf11Q9QYK7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf11Q9QYK7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf11Q9QYK7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf11Q9QYK7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf11Q9QYK7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf11Q9QYK7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf11Q9QYK7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf11Q9QYK7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf11Q9QYK7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf11Q9QYK7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf11Q9QYK7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf11Q9QYK7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf11Q9QYK7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf11Q9QYK7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf11Q9QYK7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf11Q9QYK7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf11Q9QYK7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf11Q9QYK7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf11Q9QYK7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf11Q9QYK7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf11Q9QYK7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf11Q9QYK7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf11Q9QYK7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf11Q9QYK7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf11Q9QYK7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf11Q9QYK7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rnf11Q9QYK7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf11Q9QYK7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf11Q9QYK7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf11Q9QYK7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf11Q9QYK7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms