Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Bcl11aQ9QYE3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Bcl11aQ9QYE3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Bcl11aQ9QYE3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Bcl11aQ9QYE3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Bcl11aQ9QYE3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Bcl11aQ9QYE3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Bcl11aQ9QYE3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Bcl11aQ9QYE3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Bcl11aQ9QYE3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Bcl11aQ9QYE3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Bcl11aQ9QYE3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms