Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY6

Ehd3, EH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehd3Q9QXY6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ehd3Q9QXY6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ehd3Q9QXY6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ehd3Q9QXY6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ehd3Q9QXY6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ehd3Q9QXY6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ehd3Q9QXY6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ehd3Q9QXY6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ehd3Q9QXY6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ehd3Q9QXY6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ehd3Q9QXY6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ehd3Q9QXY6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ehd3Q9QXY6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ehd3Q9QXY6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ehd3Q9QXY6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ehd3Q9QXY6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ehd3Q9QXY6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ehd3Q9QXY6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ehd3Q9QXY6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ehd3Q9QXY6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ehd3Q9QXY6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ehd3Q9QXY6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ehd3Q9QXY6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ehd3Q9QXY6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ehd3Q9QXY6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ehd3Q9QXY6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ehd3Q9QXY6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ehd3Q9QXY6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ehd3Q9QXY6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ehd3Q9QXY6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ehd3Q9QXY6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ehd3Q9QXY6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ehd3Q9QXY6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ehd3Q9QXY6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ehd3Q9QXY6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ehd3Q9QXY6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ehd3Q9QXY6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ehd3Q9QXY6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ehd3Q9QXY6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ehd3Q9QXY6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ehd3Q9QXY6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ehd3Q9QXY6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ehd3Q9QXY6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ehd3Q9QXY6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ehd3Q9QXY6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ehd3Q9QXY6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ehd3Q9QXY6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ehd3Q9QXY6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ehd3Q9QXY6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ehd3Q9QXY6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ehd3Q9QXY6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ehd3Q9QXY6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ehd3Q9QXY6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ehd3Q9QXY6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ehd3Q9QXY6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ehd3Q9QXY6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ehd3Q9QXY6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ehd3Q9QXY6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ehd3Q9QXY6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ehd3Q9QXY6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ehd3Q9QXY6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ehd3Q9QXY6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ehd3Q9QXY6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ehd3Q9QXY6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ehd3Q9QXY6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ehd3Q9QXY6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ehd3Q9QXY6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ehd3Q9QXY6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ehd3Q9QXY6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ehd3Q9QXY6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ehd3Q9QXY6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ehd3Q9QXY6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ehd3Q9QXY6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ehd3Q9QXY6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ehd3Q9QXY6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ehd3Q9QXY6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ehd3Q9QXY6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ehd3Q9QXY6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ehd3Q9QXY6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ehd3Q9QXY6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ehd3Q9QXY6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ehd3Q9QXY6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ehd3Q9QXY6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ehd3Q9QXY6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ehd3Q9QXY6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ehd3Q9QXY6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ehd3Q9QXY6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ehd3Q9QXY6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ehd3Q9QXY6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms