Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcea2Q9QVN7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcea2Q9QVN7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcea2Q9QVN7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcea2Q9QVN7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcea2Q9QVN7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcea2Q9QVN7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcea2Q9QVN7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcea2Q9QVN7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcea2Q9QVN7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcea2Q9QVN7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcea2Q9QVN7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcea2Q9QVN7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcea2Q9QVN7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcea2Q9QVN7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcea2Q9QVN7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcea2Q9QVN7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcea2Q9QVN7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcea2Q9QVN7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcea2Q9QVN7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcea2Q9QVN7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcea2Q9QVN7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcea2Q9QVN7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcea2Q9QVN7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcea2Q9QVN7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcea2Q9QVN7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcea2Q9QVN7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcea2Q9QVN7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcea2Q9QVN7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcea2Q9QVN7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcea2Q9QVN7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcea2Q9QVN7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcea2Q9QVN7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcea2Q9QVN7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcea2Q9QVN7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcea2Q9QVN7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcea2Q9QVN7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcea2Q9QVN7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcea2Q9QVN7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcea2Q9QVN7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcea2Q9QVN7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcea2Q9QVN7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcea2Q9QVN7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcea2Q9QVN7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcea2Q9QVN7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcea2Q9QVN7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcea2Q9QVN7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcea2Q9QVN7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcea2Q9QVN7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcea2Q9QVN7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcea2Q9QVN7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcea2Q9QVN7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcea2Q9QVN7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcea2Q9QVN7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcea2Q9QVN7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcea2Q9QVN7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcea2Q9QVN7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcea2Q9QVN7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcea2Q9QVN7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcea2Q9QVN7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcea2Q9QVN7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcea2Q9QVN7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcea2Q9QVN7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcea2Q9QVN7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcea2Q9QVN7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcea2Q9QVN7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcea2Q9QVN7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcea2Q9QVN7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcea2Q9QVN7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcea2Q9QVN7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcea2Q9QVN7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcea2Q9QVN7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcea2Q9QVN7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcea2Q9QVN7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcea2Q9QVN7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcea2Q9QVN7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcea2Q9QVN7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcea2Q9QVN7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcea2Q9QVN7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcea2Q9QVN7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcea2Q9QVN7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcea2Q9QVN7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcea2Q9QVN7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcea2Q9QVN7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcea2Q9QVN7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcea2Q9QVN7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcea2Q9QVN7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcea2Q9QVN7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcea2Q9QVN7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcea2Q9QVN7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcea2Q9QVN7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcea2Q9QVN7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcea2Q9QVN7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcea2Q9QVN7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcea2Q9QVN7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcea2Q9QVN7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcea2Q9QVN7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcea2Q9QVN7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcea2Q9QVN7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms