Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msh5Q9QUM7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msh5Q9QUM7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msh5Q9QUM7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Msh5Q9QUM7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msh5Q9QUM7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msh5Q9QUM7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msh5Q9QUM7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msh5Q9QUM7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msh5Q9QUM7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msh5Q9QUM7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Msh5Q9QUM7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Msh5Q9QUM7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Msh5Q9QUM7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Msh5Q9QUM7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msh5Q9QUM7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msh5Q9QUM7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msh5Q9QUM7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msh5Q9QUM7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msh5Q9QUM7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msh5Q9QUM7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msh5Q9QUM7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msh5Q9QUM7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Msh5Q9QUM7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msh5Q9QUM7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msh5Q9QUM7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msh5Q9QUM7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msh5Q9QUM7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msh5Q9QUM7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msh5Q9QUM7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Msh5Q9QUM7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msh5Q9QUM7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msh5Q9QUM7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msh5Q9QUM7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msh5Q9QUM7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Msh5Q9QUM7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Msh5Q9QUM7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Msh5Q9QUM7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msh5Q9QUM7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msh5Q9QUM7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msh5Q9QUM7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msh5Q9QUM7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msh5Q9QUM7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msh5Q9QUM7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msh5Q9QUM7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msh5Q9QUM7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msh5Q9QUM7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msh5Q9QUM7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msh5Q9QUM7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msh5Q9QUM7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Msh5Q9QUM7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Msh5Q9QUM7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Msh5Q9QUM7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Msh5Q9QUM7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Msh5Q9QUM7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Msh5Q9QUM7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msh5Q9QUM7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msh5Q9QUM7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msh5Q9QUM7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msh5Q9QUM7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msh5Q9QUM7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msh5Q9QUM7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Msh5Q9QUM7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msh5Q9QUM7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msh5Q9QUM7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Msh5Q9QUM7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msh5Q9QUM7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msh5Q9QUM7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msh5Q9QUM7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msh5Q9QUM7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msh5Q9QUM7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Msh5Q9QUM7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Msh5Q9QUM7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Msh5Q9QUM7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Msh5Q9QUM7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msh5Q9QUM7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msh5Q9QUM7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msh5Q9QUM7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msh5Q9QUM7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msh5Q9QUM7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msh5Q9QUM7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msh5Q9QUM7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msh5Q9QUM7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msh5Q9QUM7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Msh5Q9QUM7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Msh5Q9QUM7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Msh5Q9QUM7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msh5Q9QUM7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msh5Q9QUM7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msh5Q9QUM7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msh5Q9QUM7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msh5Q9QUM7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msh5Q9QUM7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msh5Q9QUM7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msh5Q9QUM7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msh5Q9QUM7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msh5Q9QUM7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msh5Q9QUM7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msh5Q9QUM7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msh5Q9QUM7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms