Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PnkpQ9JLV6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PnkpQ9JLV6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PnkpQ9JLV6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PnkpQ9JLV6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PnkpQ9JLV6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PnkpQ9JLV6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PnkpQ9JLV6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PnkpQ9JLV6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PnkpQ9JLV6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PnkpQ9JLV6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PnkpQ9JLV6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PnkpQ9JLV6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PnkpQ9JLV6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PnkpQ9JLV6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PnkpQ9JLV6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PnkpQ9JLV6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PnkpQ9JLV6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PnkpQ9JLV6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PnkpQ9JLV6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PnkpQ9JLV6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PnkpQ9JLV6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PnkpQ9JLV6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PnkpQ9JLV6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PnkpQ9JLV6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PnkpQ9JLV6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PnkpQ9JLV6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PnkpQ9JLV6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PnkpQ9JLV6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PnkpQ9JLV6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PnkpQ9JLV6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PnkpQ9JLV6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PnkpQ9JLV6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PnkpQ9JLV6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PnkpQ9JLV6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PnkpQ9JLV6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PnkpQ9JLV6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PnkpQ9JLV6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PnkpQ9JLV6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PnkpQ9JLV6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PnkpQ9JLV6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PnkpQ9JLV6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PnkpQ9JLV6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PnkpQ9JLV6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PnkpQ9JLV6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PnkpQ9JLV6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PnkpQ9JLV6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PnkpQ9JLV6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PnkpQ9JLV6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PnkpQ9JLV6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PnkpQ9JLV6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PnkpQ9JLV6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PnkpQ9JLV6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PnkpQ9JLV6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PnkpQ9JLV6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PnkpQ9JLV6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PnkpQ9JLV6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PnkpQ9JLV6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PnkpQ9JLV6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PnkpQ9JLV6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PnkpQ9JLV6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PnkpQ9JLV6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PnkpQ9JLV6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PnkpQ9JLV6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PnkpQ9JLV6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PnkpQ9JLV6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PnkpQ9JLV6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PnkpQ9JLV6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PnkpQ9JLV6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PnkpQ9JLV6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PnkpQ9JLV6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PnkpQ9JLV6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PnkpQ9JLV6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PnkpQ9JLV6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PnkpQ9JLV6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PnkpQ9JLV6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PnkpQ9JLV6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PnkpQ9JLV6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PnkpQ9JLV6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PnkpQ9JLV6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PnkpQ9JLV6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PnkpQ9JLV6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PnkpQ9JLV6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PnkpQ9JLV6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PnkpQ9JLV6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PnkpQ9JLV6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PnkpQ9JLV6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PnkpQ9JLV6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PnkpQ9JLV6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PnkpQ9JLV6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PnkpQ9JLV6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PnkpQ9JLV6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PnkpQ9JLV6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PnkpQ9JLV6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PnkpQ9JLV6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PnkpQ9JLV6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PnkpQ9JLV6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PnkpQ9JLV6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PnkpQ9JLV6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms