Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL19

Ncoa6, Nuclear receptor coactivator 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa6Q9JL19 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ncoa6Q9JL19 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ncoa6Q9JL19 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ncoa6Q9JL19 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ncoa6Q9JL19 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ncoa6Q9JL19 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ncoa6Q9JL19 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ncoa6Q9JL19 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ncoa6Q9JL19 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ncoa6Q9JL19 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ncoa6Q9JL19 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ncoa6Q9JL19 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ncoa6Q9JL19 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ncoa6Q9JL19 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ncoa6Q9JL19 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ncoa6Q9JL19 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ncoa6Q9JL19 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ncoa6Q9JL19 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ncoa6Q9JL19 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ncoa6Q9JL19 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ncoa6Q9JL19 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ncoa6Q9JL19 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ncoa6Q9JL19 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ncoa6Q9JL19 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ncoa6Q9JL19 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ncoa6Q9JL19 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ncoa6Q9JL19 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ncoa6Q9JL19 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ncoa6Q9JL19 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ncoa6Q9JL19 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ncoa6Q9JL19 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ncoa6Q9JL19 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ncoa6Q9JL19 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ncoa6Q9JL19 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ncoa6Q9JL19 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ncoa6Q9JL19 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ncoa6Q9JL19 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ncoa6Q9JL19 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ncoa6Q9JL19 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ncoa6Q9JL19 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ncoa6Q9JL19 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ncoa6Q9JL19 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ncoa6Q9JL19 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ncoa6Q9JL19 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ncoa6Q9JL19 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ncoa6Q9JL19 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ncoa6Q9JL19 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ncoa6Q9JL19 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ncoa6Q9JL19 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ncoa6Q9JL19 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ncoa6Q9JL19 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ncoa6Q9JL19 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ncoa6Q9JL19 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ncoa6Q9JL19 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ncoa6Q9JL19 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ncoa6Q9JL19 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ncoa6Q9JL19 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ncoa6Q9JL19 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Ncoa6Q9JL19 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ncoa6Q9JL19 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ncoa6Q9JL19 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ncoa6Q9JL19 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ncoa6Q9JL19 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ncoa6Q9JL19 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ncoa6Q9JL19 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ncoa6Q9JL19 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ncoa6Q9JL19 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ncoa6Q9JL19 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ncoa6Q9JL19 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ncoa6Q9JL19 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ncoa6Q9JL19 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ncoa6Q9JL19 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ncoa6Q9JL19 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ncoa6Q9JL19 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ncoa6Q9JL19 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ncoa6Q9JL19 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ncoa6Q9JL19 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ncoa6Q9JL19 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ncoa6Q9JL19 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ncoa6Q9JL19 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ncoa6Q9JL19 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ncoa6Q9JL19 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ncoa6Q9JL19 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ncoa6Q9JL19 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ncoa6Q9JL19 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ncoa6Q9JL19 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ncoa6Q9JL19 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ncoa6Q9JL19 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ncoa6Q9JL19 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms