Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gpa33Q9JKA5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpa33Q9JKA5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpa33Q9JKA5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpa33Q9JKA5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpa33Q9JKA5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpa33Q9JKA5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpa33Q9JKA5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpa33Q9JKA5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpa33Q9JKA5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpa33Q9JKA5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpa33Q9JKA5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpa33Q9JKA5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpa33Q9JKA5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpa33Q9JKA5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpa33Q9JKA5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpa33Q9JKA5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpa33Q9JKA5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpa33Q9JKA5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpa33Q9JKA5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpa33Q9JKA5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpa33Q9JKA5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpa33Q9JKA5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpa33Q9JKA5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpa33Q9JKA5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpa33Q9JKA5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpa33Q9JKA5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpa33Q9JKA5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpa33Q9JKA5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpa33Q9JKA5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpa33Q9JKA5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpa33Q9JKA5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpa33Q9JKA5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpa33Q9JKA5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms