Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV5

Cacng3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng3Q9JJV5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cacng3Q9JJV5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacng3Q9JJV5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacng3Q9JJV5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacng3Q9JJV5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cacng3Q9JJV5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacng3Q9JJV5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cacng3Q9JJV5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacng3Q9JJV5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacng3Q9JJV5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacng3Q9JJV5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacng3Q9JJV5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacng3Q9JJV5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacng3Q9JJV5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacng3Q9JJV5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacng3Q9JJV5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cacng3Q9JJV5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacng3Q9JJV5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacng3Q9JJV5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacng3Q9JJV5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacng3Q9JJV5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacng3Q9JJV5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacng3Q9JJV5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacng3Q9JJV5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacng3Q9JJV5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacng3Q9JJV5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacng3Q9JJV5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacng3Q9JJV5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacng3Q9JJV5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacng3Q9JJV5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacng3Q9JJV5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacng3Q9JJV5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacng3Q9JJV5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacng3Q9JJV5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacng3Q9JJV5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacng3Q9JJV5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacng3Q9JJV5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacng3Q9JJV5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacng3Q9JJV5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cacng3Q9JJV5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacng3Q9JJV5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacng3Q9JJV5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacng3Q9JJV5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacng3Q9JJV5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacng3Q9JJV5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacng3Q9JJV5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacng3Q9JJV5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacng3Q9JJV5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacng3Q9JJV5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacng3Q9JJV5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacng3Q9JJV5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacng3Q9JJV5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacng3Q9JJV5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacng3Q9JJV5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacng3Q9JJV5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacng3Q9JJV5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacng3Q9JJV5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacng3Q9JJV5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacng3Q9JJV5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacng3Q9JJV5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacng3Q9JJV5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacng3Q9JJV5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacng3Q9JJV5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacng3Q9JJV5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacng3Q9JJV5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacng3Q9JJV5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacng3Q9JJV5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacng3Q9JJV5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacng3Q9JJV5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacng3Q9JJV5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacng3Q9JJV5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacng3Q9JJV5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacng3Q9JJV5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacng3Q9JJV5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacng3Q9JJV5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacng3Q9JJV5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacng3Q9JJV5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacng3Q9JJV5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacng3Q9JJV5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacng3Q9JJV5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacng3Q9JJV5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacng3Q9JJV5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacng3Q9JJV5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cacng3Q9JJV5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacng3Q9JJV5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacng3Q9JJV5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacng3Q9JJV5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacng3Q9JJV5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacng3Q9JJV5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacng3Q9JJV5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacng3Q9JJV5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacng3Q9JJV5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacng3Q9JJV5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacng3Q9JJV5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacng3Q9JJV5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacng3Q9JJV5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacng3Q9JJV5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacng3Q9JJV5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacng3Q9JJV5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacng3Q9JJV5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms