Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc12a4Q9JIS8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slc12a4Q9JIS8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc12a4Q9JIS8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc12a4Q9JIS8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc12a4Q9JIS8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc12a4Q9JIS8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc12a4Q9JIS8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc12a4Q9JIS8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc12a4Q9JIS8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc12a4Q9JIS8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc12a4Q9JIS8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc12a4Q9JIS8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc12a4Q9JIS8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slc12a4Q9JIS8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc12a4Q9JIS8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc12a4Q9JIS8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc12a4Q9JIS8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc12a4Q9JIS8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc12a4Q9JIS8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc12a4Q9JIS8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc12a4Q9JIS8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc12a4Q9JIS8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc12a4Q9JIS8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc12a4Q9JIS8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc12a4Q9JIS8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc12a4Q9JIS8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc12a4Q9JIS8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc12a4Q9JIS8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc12a4Q9JIS8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc12a4Q9JIS8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc12a4Q9JIS8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc12a4Q9JIS8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc12a4Q9JIS8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc12a4Q9JIS8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc12a4Q9JIS8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc12a4Q9JIS8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc12a4Q9JIS8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc12a4Q9JIS8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc12a4Q9JIS8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc12a4Q9JIS8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc12a4Q9JIS8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc12a4Q9JIS8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc12a4Q9JIS8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc12a4Q9JIS8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc12a4Q9JIS8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc12a4Q9JIS8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc12a4Q9JIS8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc12a4Q9JIS8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc12a4Q9JIS8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc12a4Q9JIS8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc12a4Q9JIS8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc12a4Q9JIS8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc12a4Q9JIS8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc12a4Q9JIS8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc12a4Q9JIS8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc12a4Q9JIS8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc12a4Q9JIS8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc12a4Q9JIS8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc12a4Q9JIS8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc12a4Q9JIS8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc12a4Q9JIS8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc12a4Q9JIS8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc12a4Q9JIS8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc12a4Q9JIS8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc12a4Q9JIS8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc12a4Q9JIS8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc12a4Q9JIS8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc12a4Q9JIS8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc12a4Q9JIS8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc12a4Q9JIS8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc12a4Q9JIS8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc12a4Q9JIS8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc12a4Q9JIS8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc12a4Q9JIS8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc12a4Q9JIS8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc12a4Q9JIS8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc12a4Q9JIS8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc12a4Q9JIS8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc12a4Q9JIS8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc12a4Q9JIS8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc12a4Q9JIS8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc12a4Q9JIS8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc12a4Q9JIS8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc12a4Q9JIS8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc12a4Q9JIS8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc12a4Q9JIS8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc12a4Q9JIS8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc12a4Q9JIS8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc12a4Q9JIS8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc12a4Q9JIS8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc12a4Q9JIS8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc12a4Q9JIS8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc12a4Q9JIS8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc12a4Q9JIS8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms