Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET54

Palld, Palladin, mousemouse

Predictions only

Length 1,408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PalldQ9ET54 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PalldQ9ET54 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PalldQ9ET54 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PalldQ9ET54 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
PalldQ9ET54 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PalldQ9ET54 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PalldQ9ET54 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PalldQ9ET54 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PalldQ9ET54 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PalldQ9ET54 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PalldQ9ET54 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PalldQ9ET54 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PalldQ9ET54 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PalldQ9ET54 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PalldQ9ET54 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PalldQ9ET54 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PalldQ9ET54 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PalldQ9ET54 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PalldQ9ET54 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PalldQ9ET54 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PalldQ9ET54 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PalldQ9ET54 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PalldQ9ET54 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PalldQ9ET54 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PalldQ9ET54 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PalldQ9ET54 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PalldQ9ET54 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PalldQ9ET54 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PalldQ9ET54 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PalldQ9ET54 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PalldQ9ET54 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PalldQ9ET54 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PalldQ9ET54 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PalldQ9ET54 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PalldQ9ET54 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PalldQ9ET54 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PalldQ9ET54 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PalldQ9ET54 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PalldQ9ET54 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PalldQ9ET54 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PalldQ9ET54 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PalldQ9ET54 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PalldQ9ET54 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PalldQ9ET54 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PalldQ9ET54 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PalldQ9ET54 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PalldQ9ET54 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PalldQ9ET54 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PalldQ9ET54 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PalldQ9ET54 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PalldQ9ET54 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PalldQ9ET54 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PalldQ9ET54 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PalldQ9ET54 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PalldQ9ET54 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PalldQ9ET54 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PalldQ9ET54 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PalldQ9ET54 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PalldQ9ET54 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PalldQ9ET54 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PalldQ9ET54 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PalldQ9ET54 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PalldQ9ET54 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PalldQ9ET54 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PalldQ9ET54 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PalldQ9ET54 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PalldQ9ET54 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PalldQ9ET54 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PalldQ9ET54 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PalldQ9ET54 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PalldQ9ET54 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PalldQ9ET54 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PalldQ9ET54 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PalldQ9ET54 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PalldQ9ET54 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
PalldQ9ET54 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
PalldQ9ET54 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PalldQ9ET54 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PalldQ9ET54 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PalldQ9ET54 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PalldQ9ET54 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PalldQ9ET54 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PalldQ9ET54 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PalldQ9ET54 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PalldQ9ET54 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PalldQ9ET54 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PalldQ9ET54 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PalldQ9ET54 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PalldQ9ET54 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PalldQ9ET54 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PalldQ9ET54 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PalldQ9ET54 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PalldQ9ET54 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PalldQ9ET54 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PalldQ9ET54 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PalldQ9ET54 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PalldQ9ET54 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PalldQ9ET54 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PalldQ9ET54 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PalldQ9ET54 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms