Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zcchc17Q9ESX4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zcchc17Q9ESX4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zcchc17Q9ESX4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zcchc17Q9ESX4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zcchc17Q9ESX4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zcchc17Q9ESX4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zcchc17Q9ESX4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zcchc17Q9ESX4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zcchc17Q9ESX4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zcchc17Q9ESX4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zcchc17Q9ESX4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zcchc17Q9ESX4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zcchc17Q9ESX4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zcchc17Q9ESX4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zcchc17Q9ESX4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zcchc17Q9ESX4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zcchc17Q9ESX4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Zcchc17Q9ESX4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zcchc17Q9ESX4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zcchc17Q9ESX4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zcchc17Q9ESX4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zcchc17Q9ESX4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zcchc17Q9ESX4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zcchc17Q9ESX4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zcchc17Q9ESX4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zcchc17Q9ESX4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zcchc17Q9ESX4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zcchc17Q9ESX4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zcchc17Q9ESX4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zcchc17Q9ESX4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zcchc17Q9ESX4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Zcchc17Q9ESX4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zcchc17Q9ESX4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zcchc17Q9ESX4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zcchc17Q9ESX4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zcchc17Q9ESX4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zcchc17Q9ESX4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zcchc17Q9ESX4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Zcchc17Q9ESX4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zcchc17Q9ESX4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zcchc17Q9ESX4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zcchc17Q9ESX4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zcchc17Q9ESX4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zcchc17Q9ESX4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zcchc17Q9ESX4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zcchc17Q9ESX4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zcchc17Q9ESX4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zcchc17Q9ESX4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zcchc17Q9ESX4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Zcchc17Q9ESX4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Zcchc17Q9ESX4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zcchc17Q9ESX4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Zcchc17Q9ESX4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Zcchc17Q9ESX4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zcchc17Q9ESX4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zcchc17Q9ESX4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc17Q9ESX4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc17Q9ESX4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc17Q9ESX4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc17Q9ESX4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zcchc17Q9ESX4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zcchc17Q9ESX4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zcchc17Q9ESX4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zcchc17Q9ESX4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zcchc17Q9ESX4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zcchc17Q9ESX4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Zcchc17Q9ESX4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zcchc17Q9ESX4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zcchc17Q9ESX4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zcchc17Q9ESX4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zcchc17Q9ESX4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zcchc17Q9ESX4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zcchc17Q9ESX4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zcchc17Q9ESX4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zcchc17Q9ESX4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zcchc17Q9ESX4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zcchc17Q9ESX4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zcchc17Q9ESX4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zcchc17Q9ESX4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Zcchc17Q9ESX4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zcchc17Q9ESX4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zcchc17Q9ESX4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zcchc17Q9ESX4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zcchc17Q9ESX4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zcchc17Q9ESX4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zcchc17Q9ESX4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zcchc17Q9ESX4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zcchc17Q9ESX4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Zcchc17Q9ESX4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zcchc17Q9ESX4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zcchc17Q9ESX4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zcchc17Q9ESX4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zcchc17Q9ESX4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zcchc17Q9ESX4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Zcchc17Q9ESX4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zcchc17Q9ESX4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zcchc17Q9ESX4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms