Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESJ7

Irak1bp1, Interleukin-1 receptor-associated kinase 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irak1bp1Q9ESJ7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irak1bp1Q9ESJ7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irak1bp1Q9ESJ7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irak1bp1Q9ESJ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irak1bp1Q9ESJ7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irak1bp1Q9ESJ7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irak1bp1Q9ESJ7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irak1bp1Q9ESJ7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Irak1bp1Q9ESJ7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irak1bp1Q9ESJ7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irak1bp1Q9ESJ7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irak1bp1Q9ESJ7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irak1bp1Q9ESJ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irak1bp1Q9ESJ7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irak1bp1Q9ESJ7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irak1bp1Q9ESJ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irak1bp1Q9ESJ7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irak1bp1Q9ESJ7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irak1bp1Q9ESJ7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irak1bp1Q9ESJ7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irak1bp1Q9ESJ7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irak1bp1Q9ESJ7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irak1bp1Q9ESJ7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irak1bp1Q9ESJ7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irak1bp1Q9ESJ7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irak1bp1Q9ESJ7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irak1bp1Q9ESJ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irak1bp1Q9ESJ7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irak1bp1Q9ESJ7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irak1bp1Q9ESJ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irak1bp1Q9ESJ7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irak1bp1Q9ESJ7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irak1bp1Q9ESJ7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irak1bp1Q9ESJ7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irak1bp1Q9ESJ7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Irak1bp1Q9ESJ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Irak1bp1Q9ESJ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irak1bp1Q9ESJ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irak1bp1Q9ESJ7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irak1bp1Q9ESJ7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irak1bp1Q9ESJ7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irak1bp1Q9ESJ7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irak1bp1Q9ESJ7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irak1bp1Q9ESJ7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irak1bp1Q9ESJ7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Irak1bp1Q9ESJ7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irak1bp1Q9ESJ7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irak1bp1Q9ESJ7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irak1bp1Q9ESJ7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irak1bp1Q9ESJ7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irak1bp1Q9ESJ7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irak1bp1Q9ESJ7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irak1bp1Q9ESJ7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irak1bp1Q9ESJ7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irak1bp1Q9ESJ7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irak1bp1Q9ESJ7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irak1bp1Q9ESJ7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irak1bp1Q9ESJ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irak1bp1Q9ESJ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irak1bp1Q9ESJ7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irak1bp1Q9ESJ7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irak1bp1Q9ESJ7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irak1bp1Q9ESJ7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irak1bp1Q9ESJ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irak1bp1Q9ESJ7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irak1bp1Q9ESJ7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irak1bp1Q9ESJ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irak1bp1Q9ESJ7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irak1bp1Q9ESJ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irak1bp1Q9ESJ7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irak1bp1Q9ESJ7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irak1bp1Q9ESJ7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irak1bp1Q9ESJ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irak1bp1Q9ESJ7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Irak1bp1Q9ESJ7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irak1bp1Q9ESJ7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irak1bp1Q9ESJ7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irak1bp1Q9ESJ7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irak1bp1Q9ESJ7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irak1bp1Q9ESJ7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irak1bp1Q9ESJ7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irak1bp1Q9ESJ7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Irak1bp1Q9ESJ7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irak1bp1Q9ESJ7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irak1bp1Q9ESJ7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irak1bp1Q9ESJ7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irak1bp1Q9ESJ7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irak1bp1Q9ESJ7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irak1bp1Q9ESJ7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irak1bp1Q9ESJ7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irak1bp1Q9ESJ7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irak1bp1Q9ESJ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irak1bp1Q9ESJ7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irak1bp1Q9ESJ7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Irak1bp1Q9ESJ7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irak1bp1Q9ESJ7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irak1bp1Q9ESJ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irak1bp1Q9ESJ7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irak1bp1Q9ESJ7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irak1bp1Q9ESJ7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms