Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ParvbQ9ES46 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ParvbQ9ES46 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ParvbQ9ES46 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ParvbQ9ES46 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ParvbQ9ES46 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ParvbQ9ES46 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ParvbQ9ES46 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ParvbQ9ES46 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ParvbQ9ES46 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ParvbQ9ES46 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ParvbQ9ES46 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ParvbQ9ES46 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ParvbQ9ES46 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ParvbQ9ES46 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ParvbQ9ES46 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ParvbQ9ES46 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ParvbQ9ES46 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ParvbQ9ES46 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ParvbQ9ES46 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ParvbQ9ES46 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ParvbQ9ES46 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ParvbQ9ES46 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ParvbQ9ES46 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ParvbQ9ES46 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ParvbQ9ES46 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ParvbQ9ES46 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ParvbQ9ES46 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ParvbQ9ES46 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ParvbQ9ES46 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ParvbQ9ES46 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ParvbQ9ES46 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ParvbQ9ES46 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ParvbQ9ES46 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ParvbQ9ES46 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ParvbQ9ES46 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ParvbQ9ES46 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ParvbQ9ES46 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ParvbQ9ES46 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ParvbQ9ES46 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ParvbQ9ES46 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ParvbQ9ES46 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ParvbQ9ES46 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ParvbQ9ES46 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ParvbQ9ES46 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ParvbQ9ES46 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ParvbQ9ES46 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ParvbQ9ES46 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ParvbQ9ES46 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ParvbQ9ES46 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ParvbQ9ES46 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ParvbQ9ES46 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ParvbQ9ES46 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ParvbQ9ES46 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ParvbQ9ES46 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ParvbQ9ES46 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ParvbQ9ES46 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ParvbQ9ES46 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ParvbQ9ES46 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ParvbQ9ES46 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ParvbQ9ES46 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ParvbQ9ES46 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ParvbQ9ES46 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ParvbQ9ES46 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ParvbQ9ES46 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ParvbQ9ES46 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ParvbQ9ES46 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ParvbQ9ES46 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ParvbQ9ES46 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ParvbQ9ES46 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ParvbQ9ES46 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ParvbQ9ES46 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ParvbQ9ES46 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ParvbQ9ES46 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ParvbQ9ES46 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ParvbQ9ES46 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ParvbQ9ES46 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ParvbQ9ES46 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ParvbQ9ES46 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ParvbQ9ES46 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ParvbQ9ES46 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ParvbQ9ES46 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ParvbQ9ES46 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ParvbQ9ES46 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ParvbQ9ES46 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ParvbQ9ES46 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ParvbQ9ES46 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ParvbQ9ES46 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ParvbQ9ES46 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ParvbQ9ES46 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ParvbQ9ES46 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ParvbQ9ES46 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ParvbQ9ES46 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ParvbQ9ES46 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ParvbQ9ES46 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ParvbQ9ES46 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ParvbQ9ES46 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ParvbQ9ES46 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ParvbQ9ES46 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ParvbQ9ES46 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms