Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES30

C1qtnf3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf3Q9ES30 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C1qtnf3Q9ES30 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1qtnf3Q9ES30 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1qtnf3Q9ES30 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1qtnf3Q9ES30 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1qtnf3Q9ES30 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1qtnf3Q9ES30 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1qtnf3Q9ES30 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1qtnf3Q9ES30 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1qtnf3Q9ES30 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C1qtnf3Q9ES30 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C1qtnf3Q9ES30 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1qtnf3Q9ES30 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1qtnf3Q9ES30 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1qtnf3Q9ES30 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1qtnf3Q9ES30 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1qtnf3Q9ES30 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1qtnf3Q9ES30 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1qtnf3Q9ES30 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1qtnf3Q9ES30 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1qtnf3Q9ES30 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1qtnf3Q9ES30 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1qtnf3Q9ES30 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1qtnf3Q9ES30 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1qtnf3Q9ES30 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1qtnf3Q9ES30 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1qtnf3Q9ES30 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C1qtnf3Q9ES30 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1qtnf3Q9ES30 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C1qtnf3Q9ES30 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1qtnf3Q9ES30 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1qtnf3Q9ES30 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1qtnf3Q9ES30 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1qtnf3Q9ES30 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1qtnf3Q9ES30 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1qtnf3Q9ES30 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1qtnf3Q9ES30 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1qtnf3Q9ES30 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1qtnf3Q9ES30 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1qtnf3Q9ES30 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1qtnf3Q9ES30 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1qtnf3Q9ES30 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1qtnf3Q9ES30 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1qtnf3Q9ES30 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1qtnf3Q9ES30 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1qtnf3Q9ES30 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1qtnf3Q9ES30 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1qtnf3Q9ES30 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1qtnf3Q9ES30 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1qtnf3Q9ES30 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1qtnf3Q9ES30 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1qtnf3Q9ES30 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1qtnf3Q9ES30 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1qtnf3Q9ES30 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1qtnf3Q9ES30 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1qtnf3Q9ES30 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1qtnf3Q9ES30 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1qtnf3Q9ES30 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C1qtnf3Q9ES30 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1qtnf3Q9ES30 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1qtnf3Q9ES30 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1qtnf3Q9ES30 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1qtnf3Q9ES30 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1qtnf3Q9ES30 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1qtnf3Q9ES30 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1qtnf3Q9ES30 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1qtnf3Q9ES30 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1qtnf3Q9ES30 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C1qtnf3Q9ES30 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
C1qtnf3Q9ES30 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1qtnf3Q9ES30 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1qtnf3Q9ES30 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1qtnf3Q9ES30 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1qtnf3Q9ES30 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1qtnf3Q9ES30 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1qtnf3Q9ES30 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1qtnf3Q9ES30 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1qtnf3Q9ES30 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1qtnf3Q9ES30 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1qtnf3Q9ES30 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1qtnf3Q9ES30 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1qtnf3Q9ES30 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1qtnf3Q9ES30 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1qtnf3Q9ES30 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C1qtnf3Q9ES30 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1qtnf3Q9ES30 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1qtnf3Q9ES30 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1qtnf3Q9ES30 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1qtnf3Q9ES30 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1qtnf3Q9ES30 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1qtnf3Q9ES30 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1qtnf3Q9ES30 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1qtnf3Q9ES30 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1qtnf3Q9ES30 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1qtnf3Q9ES30 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1qtnf3Q9ES30 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1qtnf3Q9ES30 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1qtnf3Q9ES30 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1qtnf3Q9ES30 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1qtnf3Q9ES30 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms