Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MesdQ9ERE7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MesdQ9ERE7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MesdQ9ERE7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MesdQ9ERE7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MesdQ9ERE7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MesdQ9ERE7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MesdQ9ERE7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MesdQ9ERE7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MesdQ9ERE7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MesdQ9ERE7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MesdQ9ERE7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MesdQ9ERE7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MesdQ9ERE7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MesdQ9ERE7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MesdQ9ERE7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MesdQ9ERE7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MesdQ9ERE7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MesdQ9ERE7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MesdQ9ERE7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MesdQ9ERE7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MesdQ9ERE7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MesdQ9ERE7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MesdQ9ERE7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MesdQ9ERE7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MesdQ9ERE7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MesdQ9ERE7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MesdQ9ERE7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MesdQ9ERE7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MesdQ9ERE7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MesdQ9ERE7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MesdQ9ERE7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MesdQ9ERE7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MesdQ9ERE7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MesdQ9ERE7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MesdQ9ERE7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MesdQ9ERE7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MesdQ9ERE7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MesdQ9ERE7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MesdQ9ERE7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MesdQ9ERE7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MesdQ9ERE7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MesdQ9ERE7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MesdQ9ERE7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MesdQ9ERE7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MesdQ9ERE7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MesdQ9ERE7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MesdQ9ERE7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MesdQ9ERE7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MesdQ9ERE7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MesdQ9ERE7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MesdQ9ERE7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MesdQ9ERE7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MesdQ9ERE7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MesdQ9ERE7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MesdQ9ERE7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MesdQ9ERE7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MesdQ9ERE7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MesdQ9ERE7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MesdQ9ERE7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MesdQ9ERE7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MesdQ9ERE7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MesdQ9ERE7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MesdQ9ERE7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MesdQ9ERE7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MesdQ9ERE7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MesdQ9ERE7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MesdQ9ERE7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MesdQ9ERE7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MesdQ9ERE7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MesdQ9ERE7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MesdQ9ERE7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MesdQ9ERE7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MesdQ9ERE7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MesdQ9ERE7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MesdQ9ERE7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MesdQ9ERE7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
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