Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r29Q9EQ41 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r29Q9EQ41 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r29Q9EQ41 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r29Q9EQ41 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r29Q9EQ41 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r29Q9EQ41 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r29Q9EQ41 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r29Q9EQ41 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn1r29Q9EQ41 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r29Q9EQ41 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r29Q9EQ41 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r29Q9EQ41 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r29Q9EQ41 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r29Q9EQ41 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r29Q9EQ41 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r29Q9EQ41 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r29Q9EQ41 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r29Q9EQ41 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r29Q9EQ41 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r29Q9EQ41 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn1r29Q9EQ41 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r29Q9EQ41 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r29Q9EQ41 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r29Q9EQ41 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r29Q9EQ41 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r29Q9EQ41 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r29Q9EQ41 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r29Q9EQ41 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r29Q9EQ41 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r29Q9EQ41 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r29Q9EQ41 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r29Q9EQ41 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r29Q9EQ41 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r29Q9EQ41 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r29Q9EQ41 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r29Q9EQ41 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r29Q9EQ41 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r29Q9EQ41 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r29Q9EQ41 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r29Q9EQ41 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r29Q9EQ41 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r29Q9EQ41 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r29Q9EQ41 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r29Q9EQ41 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r29Q9EQ41 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r29Q9EQ41 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r29Q9EQ41 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r29Q9EQ41 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r29Q9EQ41 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r29Q9EQ41 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r29Q9EQ41 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r29Q9EQ41 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r29Q9EQ41 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r29Q9EQ41 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r29Q9EQ41 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r29Q9EQ41 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r29Q9EQ41 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r29Q9EQ41 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r29Q9EQ41 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r29Q9EQ41 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r29Q9EQ41 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r29Q9EQ41 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r29Q9EQ41 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r29Q9EQ41 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r29Q9EQ41 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r29Q9EQ41 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r29Q9EQ41 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r29Q9EQ41 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r29Q9EQ41 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r29Q9EQ41 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r29Q9EQ41 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r29Q9EQ41 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r29Q9EQ41 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r29Q9EQ41 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r29Q9EQ41 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r29Q9EQ41 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r29Q9EQ41 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r29Q9EQ41 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r29Q9EQ41 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r29Q9EQ41 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r29Q9EQ41 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r29Q9EQ41 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r29Q9EQ41 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r29Q9EQ41 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r29Q9EQ41 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r29Q9EQ41 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r29Q9EQ41 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r29Q9EQ41 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r29Q9EQ41 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn1r29Q9EQ41 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r29Q9EQ41 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r29Q9EQ41 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r29Q9EQ41 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r29Q9EQ41 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r29Q9EQ41 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r29Q9EQ41 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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