Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Clstn1Q9EPL2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clstn1Q9EPL2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Clstn1Q9EPL2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Clstn1Q9EPL2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Clstn1Q9EPL2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clstn1Q9EPL2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clstn1Q9EPL2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clstn1Q9EPL2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clstn1Q9EPL2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clstn1Q9EPL2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Clstn1Q9EPL2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Clstn1Q9EPL2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Clstn1Q9EPL2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Clstn1Q9EPL2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Clstn1Q9EPL2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Clstn1Q9EPL2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Clstn1Q9EPL2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Clstn1Q9EPL2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clstn1Q9EPL2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clstn1Q9EPL2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Clstn1Q9EPL2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Clstn1Q9EPL2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Clstn1Q9EPL2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Clstn1Q9EPL2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Clstn1Q9EPL2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Clstn1Q9EPL2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Clstn1Q9EPL2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clstn1Q9EPL2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clstn1Q9EPL2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clstn1Q9EPL2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clstn1Q9EPL2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clstn1Q9EPL2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clstn1Q9EPL2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Clstn1Q9EPL2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clstn1Q9EPL2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Clstn1Q9EPL2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clstn1Q9EPL2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Clstn1Q9EPL2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Clstn1Q9EPL2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clstn1Q9EPL2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clstn1Q9EPL2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clstn1Q9EPL2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clstn1Q9EPL2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clstn1Q9EPL2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clstn1Q9EPL2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clstn1Q9EPL2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clstn1Q9EPL2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clstn1Q9EPL2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clstn1Q9EPL2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clstn1Q9EPL2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clstn1Q9EPL2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Clstn1Q9EPL2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clstn1Q9EPL2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clstn1Q9EPL2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Clstn1Q9EPL2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clstn1Q9EPL2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clstn1Q9EPL2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Clstn1Q9EPL2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clstn1Q9EPL2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clstn1Q9EPL2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clstn1Q9EPL2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clstn1Q9EPL2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clstn1Q9EPL2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clstn1Q9EPL2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clstn1Q9EPL2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clstn1Q9EPL2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clstn1Q9EPL2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clstn1Q9EPL2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clstn1Q9EPL2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Clstn1Q9EPL2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clstn1Q9EPL2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clstn1Q9EPL2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clstn1Q9EPL2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clstn1Q9EPL2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clstn1Q9EPL2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Clstn1Q9EPL2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Clstn1Q9EPL2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clstn1Q9EPL2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clstn1Q9EPL2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clstn1Q9EPL2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clstn1Q9EPL2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clstn1Q9EPL2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clstn1Q9EPL2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clstn1Q9EPL2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clstn1Q9EPL2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clstn1Q9EPL2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clstn1Q9EPL2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clstn1Q9EPL2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clstn1Q9EPL2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clstn1Q9EPL2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clstn1Q9EPL2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clstn1Q9EPL2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clstn1Q9EPL2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clstn1Q9EPL2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clstn1Q9EPL2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clstn1Q9EPL2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clstn1Q9EPL2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clstn1Q9EPL2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clstn1Q9EPL2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms