Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gpr88Q9EPB7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gpr88Q9EPB7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpr88Q9EPB7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gpr88Q9EPB7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gpr88Q9EPB7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gpr88Q9EPB7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpr88Q9EPB7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpr88Q9EPB7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpr88Q9EPB7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gpr88Q9EPB7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpr88Q9EPB7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpr88Q9EPB7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpr88Q9EPB7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpr88Q9EPB7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpr88Q9EPB7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpr88Q9EPB7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpr88Q9EPB7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpr88Q9EPB7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpr88Q9EPB7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpr88Q9EPB7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpr88Q9EPB7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpr88Q9EPB7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpr88Q9EPB7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpr88Q9EPB7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpr88Q9EPB7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpr88Q9EPB7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpr88Q9EPB7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpr88Q9EPB7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpr88Q9EPB7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpr88Q9EPB7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpr88Q9EPB7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpr88Q9EPB7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpr88Q9EPB7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpr88Q9EPB7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpr88Q9EPB7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpr88Q9EPB7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpr88Q9EPB7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpr88Q9EPB7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpr88Q9EPB7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpr88Q9EPB7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpr88Q9EPB7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpr88Q9EPB7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpr88Q9EPB7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpr88Q9EPB7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpr88Q9EPB7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpr88Q9EPB7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpr88Q9EPB7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpr88Q9EPB7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpr88Q9EPB7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpr88Q9EPB7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpr88Q9EPB7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpr88Q9EPB7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gpr88Q9EPB7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpr88Q9EPB7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpr88Q9EPB7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpr88Q9EPB7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gpr88Q9EPB7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpr88Q9EPB7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpr88Q9EPB7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpr88Q9EPB7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpr88Q9EPB7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpr88Q9EPB7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpr88Q9EPB7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpr88Q9EPB7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpr88Q9EPB7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpr88Q9EPB7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpr88Q9EPB7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpr88Q9EPB7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpr88Q9EPB7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpr88Q9EPB7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpr88Q9EPB7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpr88Q9EPB7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpr88Q9EPB7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpr88Q9EPB7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpr88Q9EPB7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpr88Q9EPB7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpr88Q9EPB7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpr88Q9EPB7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpr88Q9EPB7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpr88Q9EPB7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpr88Q9EPB7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpr88Q9EPB7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpr88Q9EPB7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpr88Q9EPB7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpr88Q9EPB7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpr88Q9EPB7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpr88Q9EPB7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpr88Q9EPB7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpr88Q9EPB7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpr88Q9EPB7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpr88Q9EPB7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpr88Q9EPB7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpr88Q9EPB7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpr88Q9EPB7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpr88Q9EPB7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpr88Q9EPB7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpr88Q9EPB7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gpr88Q9EPB7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpr88Q9EPB7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms