Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem43Q9DBS1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem43Q9DBS1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem43Q9DBS1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem43Q9DBS1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmem43Q9DBS1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem43Q9DBS1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmem43Q9DBS1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem43Q9DBS1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms