Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med29Q9DB91 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med29Q9DB91 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med29Q9DB91 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med29Q9DB91 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med29Q9DB91 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med29Q9DB91 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med29Q9DB91 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med29Q9DB91 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med29Q9DB91 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med29Q9DB91 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med29Q9DB91 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Med29Q9DB91 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Med29Q9DB91 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med29Q9DB91 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med29Q9DB91 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med29Q9DB91 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med29Q9DB91 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med29Q9DB91 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med29Q9DB91 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med29Q9DB91 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med29Q9DB91 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Med29Q9DB91 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med29Q9DB91 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med29Q9DB91 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med29Q9DB91 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med29Q9DB91 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med29Q9DB91 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med29Q9DB91 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med29Q9DB91 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med29Q9DB91 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med29Q9DB91 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Med29Q9DB91 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med29Q9DB91 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Med29Q9DB91 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med29Q9DB91 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Med29Q9DB91 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med29Q9DB91 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med29Q9DB91 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med29Q9DB91 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med29Q9DB91 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Med29Q9DB91 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med29Q9DB91 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med29Q9DB91 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med29Q9DB91 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med29Q9DB91 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med29Q9DB91 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med29Q9DB91 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med29Q9DB91 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med29Q9DB91 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms