Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU9

Znf654, Zinc finger protein 654, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf654Q9DAU9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf654Q9DAU9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf654Q9DAU9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf654Q9DAU9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf654Q9DAU9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf654Q9DAU9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf654Q9DAU9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf654Q9DAU9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf654Q9DAU9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf654Q9DAU9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf654Q9DAU9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf654Q9DAU9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf654Q9DAU9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf654Q9DAU9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Znf654Q9DAU9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf654Q9DAU9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf654Q9DAU9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf654Q9DAU9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf654Q9DAU9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf654Q9DAU9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf654Q9DAU9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf654Q9DAU9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf654Q9DAU9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf654Q9DAU9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf654Q9DAU9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf654Q9DAU9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf654Q9DAU9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf654Q9DAU9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf654Q9DAU9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf654Q9DAU9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf654Q9DAU9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf654Q9DAU9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf654Q9DAU9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf654Q9DAU9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf654Q9DAU9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf654Q9DAU9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf654Q9DAU9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf654Q9DAU9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf654Q9DAU9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf654Q9DAU9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf654Q9DAU9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf654Q9DAU9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf654Q9DAU9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf654Q9DAU9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf654Q9DAU9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf654Q9DAU9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf654Q9DAU9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf654Q9DAU9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf654Q9DAU9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf654Q9DAU9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf654Q9DAU9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf654Q9DAU9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf654Q9DAU9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf654Q9DAU9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf654Q9DAU9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf654Q9DAU9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf654Q9DAU9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf654Q9DAU9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf654Q9DAU9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf654Q9DAU9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf654Q9DAU9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf654Q9DAU9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf654Q9DAU9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf654Q9DAU9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf654Q9DAU9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf654Q9DAU9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf654Q9DAU9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf654Q9DAU9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf654Q9DAU9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf654Q9DAU9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf654Q9DAU9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf654Q9DAU9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf654Q9DAU9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf654Q9DAU9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf654Q9DAU9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf654Q9DAU9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf654Q9DAU9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf654Q9DAU9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf654Q9DAU9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf654Q9DAU9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms