Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc54Q9DAL3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc54Q9DAL3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc54Q9DAL3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc54Q9DAL3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc54Q9DAL3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc54Q9DAL3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc54Q9DAL3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc54Q9DAL3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc54Q9DAL3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc54Q9DAL3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc54Q9DAL3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc54Q9DAL3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc54Q9DAL3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc54Q9DAL3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc54Q9DAL3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc54Q9DAL3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc54Q9DAL3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc54Q9DAL3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc54Q9DAL3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc54Q9DAL3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc54Q9DAL3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc54Q9DAL3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc54Q9DAL3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc54Q9DAL3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc54Q9DAL3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc54Q9DAL3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc54Q9DAL3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc54Q9DAL3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc54Q9DAL3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc54Q9DAL3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc54Q9DAL3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc54Q9DAL3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc54Q9DAL3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc54Q9DAL3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc54Q9DAL3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc54Q9DAL3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc54Q9DAL3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc54Q9DAL3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc54Q9DAL3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc54Q9DAL3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc54Q9DAL3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc54Q9DAL3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc54Q9DAL3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc54Q9DAL3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc54Q9DAL3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc54Q9DAL3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc54Q9DAL3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc54Q9DAL3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc54Q9DAL3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc54Q9DAL3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc54Q9DAL3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc54Q9DAL3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc54Q9DAL3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc54Q9DAL3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc54Q9DAL3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc54Q9DAL3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc54Q9DAL3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc54Q9DAL3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc54Q9DAL3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc54Q9DAL3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc54Q9DAL3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc54Q9DAL3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc54Q9DAL3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc54Q9DAL3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc54Q9DAL3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc54Q9DAL3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc54Q9DAL3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc54Q9DAL3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc54Q9DAL3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc54Q9DAL3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc54Q9DAL3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc54Q9DAL3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc54Q9DAL3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms