Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK2

Pacrg, Parkin coregulated gene protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PacrgQ9DAK2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PacrgQ9DAK2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PacrgQ9DAK2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PacrgQ9DAK2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PacrgQ9DAK2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PacrgQ9DAK2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PacrgQ9DAK2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PacrgQ9DAK2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PacrgQ9DAK2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PacrgQ9DAK2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PacrgQ9DAK2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PacrgQ9DAK2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PacrgQ9DAK2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PacrgQ9DAK2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PacrgQ9DAK2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PacrgQ9DAK2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PacrgQ9DAK2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PacrgQ9DAK2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PacrgQ9DAK2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PacrgQ9DAK2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PacrgQ9DAK2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PacrgQ9DAK2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PacrgQ9DAK2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PacrgQ9DAK2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PacrgQ9DAK2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PacrgQ9DAK2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PacrgQ9DAK2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PacrgQ9DAK2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PacrgQ9DAK2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PacrgQ9DAK2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PacrgQ9DAK2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PacrgQ9DAK2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PacrgQ9DAK2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PacrgQ9DAK2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PacrgQ9DAK2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PacrgQ9DAK2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PacrgQ9DAK2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PacrgQ9DAK2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PacrgQ9DAK2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PacrgQ9DAK2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PacrgQ9DAK2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PacrgQ9DAK2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PacrgQ9DAK2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PacrgQ9DAK2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PacrgQ9DAK2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PacrgQ9DAK2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PacrgQ9DAK2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PacrgQ9DAK2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PacrgQ9DAK2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PacrgQ9DAK2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PacrgQ9DAK2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PacrgQ9DAK2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PacrgQ9DAK2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PacrgQ9DAK2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PacrgQ9DAK2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PacrgQ9DAK2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PacrgQ9DAK2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PacrgQ9DAK2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PacrgQ9DAK2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PacrgQ9DAK2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PacrgQ9DAK2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PacrgQ9DAK2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PacrgQ9DAK2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PacrgQ9DAK2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PacrgQ9DAK2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PacrgQ9DAK2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PacrgQ9DAK2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PacrgQ9DAK2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PacrgQ9DAK2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PacrgQ9DAK2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PacrgQ9DAK2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PacrgQ9DAK2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PacrgQ9DAK2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PacrgQ9DAK2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PacrgQ9DAK2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PacrgQ9DAK2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PacrgQ9DAK2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PacrgQ9DAK2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PacrgQ9DAK2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PacrgQ9DAK2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PacrgQ9DAK2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PacrgQ9DAK2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PacrgQ9DAK2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PacrgQ9DAK2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 291.1 ms