Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rsph3bQ9DA80 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rsph3bQ9DA80 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rsph3bQ9DA80 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rsph3bQ9DA80 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rsph3bQ9DA80 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rsph3bQ9DA80 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Rsph3bQ9DA80 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rsph3bQ9DA80 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rsph3bQ9DA80 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rsph3bQ9DA80 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rsph3bQ9DA80 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rsph3bQ9DA80 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rsph3bQ9DA80 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rsph3bQ9DA80 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rsph3bQ9DA80 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rsph3bQ9DA80 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rsph3bQ9DA80 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rsph3bQ9DA80 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rsph3bQ9DA80 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rsph3bQ9DA80 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rsph3bQ9DA80 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rsph3bQ9DA80 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rsph3bQ9DA80 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Rsph3bQ9DA80 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rsph3bQ9DA80 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rsph3bQ9DA80 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rsph3bQ9DA80 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rsph3bQ9DA80 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rsph3bQ9DA80 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rsph3bQ9DA80 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rsph3bQ9DA80 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rsph3bQ9DA80 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rsph3bQ9DA80 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rsph3bQ9DA80 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rsph3bQ9DA80 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rsph3bQ9DA80 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rsph3bQ9DA80 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rsph3bQ9DA80 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rsph3bQ9DA80 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rsph3bQ9DA80 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rsph3bQ9DA80 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Rsph3bQ9DA80 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rsph3bQ9DA80 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rsph3bQ9DA80 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rsph3bQ9DA80 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rsph3bQ9DA80 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rsph3bQ9DA80 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rsph3bQ9DA80 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rsph3bQ9DA80 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rsph3bQ9DA80 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rsph3bQ9DA80 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rsph3bQ9DA80 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rsph3bQ9DA80 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rsph3bQ9DA80 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rsph3bQ9DA80 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Rsph3bQ9DA80 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rsph3bQ9DA80 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rsph3bQ9DA80 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rsph3bQ9DA80 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rsph3bQ9DA80 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsph3bQ9DA80 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsph3bQ9DA80 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsph3bQ9DA80 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rsph3bQ9DA80 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsph3bQ9DA80 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsph3bQ9DA80 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsph3bQ9DA80 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsph3bQ9DA80 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rsph3bQ9DA80 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rsph3bQ9DA80 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsph3bQ9DA80 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsph3bQ9DA80 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rsph3bQ9DA80 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rsph3bQ9DA80 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rsph3bQ9DA80 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rsph3bQ9DA80 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rsph3bQ9DA80 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rsph3bQ9DA80 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rsph3bQ9DA80 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rsph3bQ9DA80 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rsph3bQ9DA80 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rsph3bQ9DA80 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rsph3bQ9DA80 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rsph3bQ9DA80 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rsph3bQ9DA80 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rsph3bQ9DA80 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rsph3bQ9DA80 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rsph3bQ9DA80 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rsph3bQ9DA80 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rsph3bQ9DA80 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rsph3bQ9DA80 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rsph3bQ9DA80 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rsph3bQ9DA80 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rsph3bQ9DA80 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rsph3bQ9DA80 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rsph3bQ9DA80 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rsph3bQ9DA80 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms