Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ift43Q9DA69 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ift43Q9DA69 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ift43Q9DA69 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ift43Q9DA69 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ift43Q9DA69 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ift43Q9DA69 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ift43Q9DA69 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift43Q9DA69 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift43Q9DA69 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift43Q9DA69 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift43Q9DA69 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift43Q9DA69 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift43Q9DA69 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift43Q9DA69 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift43Q9DA69 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift43Q9DA69 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift43Q9DA69 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift43Q9DA69 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift43Q9DA69 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift43Q9DA69 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift43Q9DA69 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift43Q9DA69 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift43Q9DA69 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift43Q9DA69 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift43Q9DA69 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift43Q9DA69 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift43Q9DA69 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift43Q9DA69 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift43Q9DA69 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift43Q9DA69 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ift43Q9DA69 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ift43Q9DA69 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ift43Q9DA69 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ift43Q9DA69 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift43Q9DA69 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift43Q9DA69 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift43Q9DA69 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift43Q9DA69 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift43Q9DA69 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift43Q9DA69 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift43Q9DA69 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift43Q9DA69 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift43Q9DA69 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift43Q9DA69 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift43Q9DA69 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift43Q9DA69 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift43Q9DA69 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift43Q9DA69 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift43Q9DA69 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift43Q9DA69 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift43Q9DA69 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift43Q9DA69 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift43Q9DA69 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift43Q9DA69 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift43Q9DA69 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift43Q9DA69 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift43Q9DA69 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift43Q9DA69 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift43Q9DA69 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift43Q9DA69 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift43Q9DA69 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift43Q9DA69 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ift43Q9DA69 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ift43Q9DA69 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift43Q9DA69 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift43Q9DA69 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift43Q9DA69 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift43Q9DA69 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift43Q9DA69 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift43Q9DA69 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift43Q9DA69 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift43Q9DA69 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift43Q9DA69 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift43Q9DA69 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift43Q9DA69 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift43Q9DA69 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ift43Q9DA69 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift43Q9DA69 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift43Q9DA69 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift43Q9DA69 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift43Q9DA69 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift43Q9DA69 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift43Q9DA69 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift43Q9DA69 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift43Q9DA69 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift43Q9DA69 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift43Q9DA69 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift43Q9DA69 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift43Q9DA69 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift43Q9DA69 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift43Q9DA69 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift43Q9DA69 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift43Q9DA69 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ift43Q9DA69 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ift43Q9DA69 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ift43Q9DA69 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ift43Q9DA69 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ift43Q9DA69 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift43Q9DA69 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms