Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P2

Ccdc103, Coiled-coil domain-containing protein 103, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc103Q9D9P2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc103Q9D9P2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc103Q9D9P2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc103Q9D9P2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc103Q9D9P2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc103Q9D9P2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc103Q9D9P2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc103Q9D9P2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc103Q9D9P2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc103Q9D9P2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc103Q9D9P2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc103Q9D9P2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc103Q9D9P2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc103Q9D9P2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc103Q9D9P2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc103Q9D9P2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc103Q9D9P2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc103Q9D9P2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc103Q9D9P2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc103Q9D9P2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc103Q9D9P2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc103Q9D9P2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc103Q9D9P2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc103Q9D9P2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc103Q9D9P2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc103Q9D9P2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc103Q9D9P2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc103Q9D9P2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc103Q9D9P2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc103Q9D9P2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc103Q9D9P2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc103Q9D9P2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc103Q9D9P2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc103Q9D9P2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc103Q9D9P2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc103Q9D9P2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc103Q9D9P2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc103Q9D9P2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc103Q9D9P2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc103Q9D9P2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc103Q9D9P2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc103Q9D9P2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc103Q9D9P2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc103Q9D9P2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc103Q9D9P2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc103Q9D9P2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc103Q9D9P2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc103Q9D9P2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc103Q9D9P2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc103Q9D9P2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc103Q9D9P2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc103Q9D9P2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc103Q9D9P2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc103Q9D9P2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc103Q9D9P2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc103Q9D9P2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc103Q9D9P2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc103Q9D9P2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc103Q9D9P2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc103Q9D9P2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc103Q9D9P2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc103Q9D9P2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc103Q9D9P2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc103Q9D9P2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc103Q9D9P2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc103Q9D9P2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc103Q9D9P2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc103Q9D9P2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc103Q9D9P2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc103Q9D9P2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc103Q9D9P2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc103Q9D9P2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc103Q9D9P2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc103Q9D9P2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc103Q9D9P2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc103Q9D9P2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms