Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C0

1700109H08Rik, RIKEN cDNA 1700109H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700109H08RikQ9D9C0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700109H08RikQ9D9C0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700109H08RikQ9D9C0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700109H08RikQ9D9C0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700109H08RikQ9D9C0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700109H08RikQ9D9C0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700109H08RikQ9D9C0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700109H08RikQ9D9C0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
1700109H08RikQ9D9C0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700109H08RikQ9D9C0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700109H08RikQ9D9C0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700109H08RikQ9D9C0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700109H08RikQ9D9C0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700109H08RikQ9D9C0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700109H08RikQ9D9C0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700109H08RikQ9D9C0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700109H08RikQ9D9C0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700109H08RikQ9D9C0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700109H08RikQ9D9C0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700109H08RikQ9D9C0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700109H08RikQ9D9C0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700109H08RikQ9D9C0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700109H08RikQ9D9C0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700109H08RikQ9D9C0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700109H08RikQ9D9C0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700109H08RikQ9D9C0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
1700109H08RikQ9D9C0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700109H08RikQ9D9C0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700109H08RikQ9D9C0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700109H08RikQ9D9C0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700109H08RikQ9D9C0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700109H08RikQ9D9C0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700109H08RikQ9D9C0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700109H08RikQ9D9C0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700109H08RikQ9D9C0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700109H08RikQ9D9C0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700109H08RikQ9D9C0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700109H08RikQ9D9C0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700109H08RikQ9D9C0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1700109H08RikQ9D9C0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700109H08RikQ9D9C0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700109H08RikQ9D9C0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700109H08RikQ9D9C0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700109H08RikQ9D9C0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700109H08RikQ9D9C0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700109H08RikQ9D9C0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700109H08RikQ9D9C0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700109H08RikQ9D9C0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700109H08RikQ9D9C0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700109H08RikQ9D9C0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700109H08RikQ9D9C0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700109H08RikQ9D9C0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
1700109H08RikQ9D9C0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700109H08RikQ9D9C0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700109H08RikQ9D9C0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700109H08RikQ9D9C0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700109H08RikQ9D9C0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700109H08RikQ9D9C0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700109H08RikQ9D9C0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700109H08RikQ9D9C0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700109H08RikQ9D9C0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700109H08RikQ9D9C0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700109H08RikQ9D9C0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700109H08RikQ9D9C0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700109H08RikQ9D9C0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700109H08RikQ9D9C0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700109H08RikQ9D9C0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700109H08RikQ9D9C0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700109H08RikQ9D9C0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700109H08RikQ9D9C0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
1700109H08RikQ9D9C0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700109H08RikQ9D9C0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700109H08RikQ9D9C0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700109H08RikQ9D9C0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700109H08RikQ9D9C0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700109H08RikQ9D9C0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700109H08RikQ9D9C0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms