Protein–RNA interactions for Protein: Q9D920

Borcs5, BLOC-1-related complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs5Q9D920 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Borcs5Q9D920 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Borcs5Q9D920 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Borcs5Q9D920 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Borcs5Q9D920 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Borcs5Q9D920 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Borcs5Q9D920 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Borcs5Q9D920 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Borcs5Q9D920 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Borcs5Q9D920 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Borcs5Q9D920 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Borcs5Q9D920 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Borcs5Q9D920 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Borcs5Q9D920 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Borcs5Q9D920 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Borcs5Q9D920 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Borcs5Q9D920 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Borcs5Q9D920 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Borcs5Q9D920 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Borcs5Q9D920 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Borcs5Q9D920 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Borcs5Q9D920 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Borcs5Q9D920 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Borcs5Q9D920 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Borcs5Q9D920 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Borcs5Q9D920 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Borcs5Q9D920 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Borcs5Q9D920 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Borcs5Q9D920 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Borcs5Q9D920 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Borcs5Q9D920 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Borcs5Q9D920 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Borcs5Q9D920 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Borcs5Q9D920 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Borcs5Q9D920 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Borcs5Q9D920 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Borcs5Q9D920 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Borcs5Q9D920 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms