Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnot8Q9D8X5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnot8Q9D8X5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnot8Q9D8X5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnot8Q9D8X5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnot8Q9D8X5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnot8Q9D8X5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnot8Q9D8X5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot8Q9D8X5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot8Q9D8X5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot8Q9D8X5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot8Q9D8X5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot8Q9D8X5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot8Q9D8X5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot8Q9D8X5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot8Q9D8X5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot8Q9D8X5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot8Q9D8X5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot8Q9D8X5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot8Q9D8X5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cnot8Q9D8X5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnot8Q9D8X5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnot8Q9D8X5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnot8Q9D8X5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnot8Q9D8X5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnot8Q9D8X5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnot8Q9D8X5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnot8Q9D8X5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnot8Q9D8X5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnot8Q9D8X5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnot8Q9D8X5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnot8Q9D8X5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnot8Q9D8X5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnot8Q9D8X5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnot8Q9D8X5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnot8Q9D8X5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnot8Q9D8X5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnot8Q9D8X5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnot8Q9D8X5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnot8Q9D8X5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnot8Q9D8X5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnot8Q9D8X5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnot8Q9D8X5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnot8Q9D8X5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnot8Q9D8X5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnot8Q9D8X5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnot8Q9D8X5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnot8Q9D8X5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnot8Q9D8X5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnot8Q9D8X5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnot8Q9D8X5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnot8Q9D8X5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnot8Q9D8X5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnot8Q9D8X5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnot8Q9D8X5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnot8Q9D8X5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnot8Q9D8X5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnot8Q9D8X5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnot8Q9D8X5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnot8Q9D8X5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnot8Q9D8X5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnot8Q9D8X5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnot8Q9D8X5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnot8Q9D8X5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnot8Q9D8X5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnot8Q9D8X5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnot8Q9D8X5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnot8Q9D8X5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnot8Q9D8X5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnot8Q9D8X5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnot8Q9D8X5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnot8Q9D8X5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnot8Q9D8X5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cnot8Q9D8X5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cnot8Q9D8X5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cnot8Q9D8X5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cnot8Q9D8X5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cnot8Q9D8X5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cnot8Q9D8X5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cnot8Q9D8X5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnot8Q9D8X5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnot8Q9D8X5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnot8Q9D8X5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot8Q9D8X5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnot8Q9D8X5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnot8Q9D8X5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnot8Q9D8X5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnot8Q9D8X5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnot8Q9D8X5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnot8Q9D8X5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnot8Q9D8X5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnot8Q9D8X5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnot8Q9D8X5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnot8Q9D8X5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnot8Q9D8X5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot8Q9D8X5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot8Q9D8X5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot8Q9D8X5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot8Q9D8X5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms