Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Alkbh4Q9D8F1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Alkbh4Q9D8F1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Alkbh4Q9D8F1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Alkbh4Q9D8F1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Alkbh4Q9D8F1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Alkbh4Q9D8F1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Alkbh4Q9D8F1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Alkbh4Q9D8F1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Alkbh4Q9D8F1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Alkbh4Q9D8F1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Alkbh4Q9D8F1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Alkbh4Q9D8F1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Alkbh4Q9D8F1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Alkbh4Q9D8F1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Alkbh4Q9D8F1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Alkbh4Q9D8F1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Alkbh4Q9D8F1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Alkbh4Q9D8F1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alkbh4Q9D8F1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alkbh4Q9D8F1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alkbh4Q9D8F1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Alkbh4Q9D8F1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alkbh4Q9D8F1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alkbh4Q9D8F1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alkbh4Q9D8F1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alkbh4Q9D8F1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alkbh4Q9D8F1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alkbh4Q9D8F1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alkbh4Q9D8F1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alkbh4Q9D8F1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Alkbh4Q9D8F1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Alkbh4Q9D8F1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Alkbh4Q9D8F1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Alkbh4Q9D8F1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Alkbh4Q9D8F1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alkbh4Q9D8F1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Alkbh4Q9D8F1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Alkbh4Q9D8F1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Alkbh4Q9D8F1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alkbh4Q9D8F1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alkbh4Q9D8F1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alkbh4Q9D8F1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Alkbh4Q9D8F1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Alkbh4Q9D8F1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alkbh4Q9D8F1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alkbh4Q9D8F1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Alkbh4Q9D8F1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Alkbh4Q9D8F1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Alkbh4Q9D8F1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Alkbh4Q9D8F1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Alkbh4Q9D8F1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Alkbh4Q9D8F1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Alkbh4Q9D8F1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Alkbh4Q9D8F1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Alkbh4Q9D8F1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Alkbh4Q9D8F1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Alkbh4Q9D8F1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Alkbh4Q9D8F1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Alkbh4Q9D8F1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Alkbh4Q9D8F1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Alkbh4Q9D8F1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Alkbh4Q9D8F1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Alkbh4Q9D8F1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alkbh4Q9D8F1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alkbh4Q9D8F1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alkbh4Q9D8F1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Alkbh4Q9D8F1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alkbh4Q9D8F1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Alkbh4Q9D8F1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Alkbh4Q9D8F1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Alkbh4Q9D8F1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Alkbh4Q9D8F1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alkbh4Q9D8F1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alkbh4Q9D8F1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alkbh4Q9D8F1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alkbh4Q9D8F1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alkbh4Q9D8F1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alkbh4Q9D8F1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alkbh4Q9D8F1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Alkbh4Q9D8F1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Alkbh4Q9D8F1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Alkbh4Q9D8F1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alkbh4Q9D8F1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alkbh4Q9D8F1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alkbh4Q9D8F1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alkbh4Q9D8F1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alkbh4Q9D8F1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alkbh4Q9D8F1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alkbh4Q9D8F1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alkbh4Q9D8F1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alkbh4Q9D8F1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alkbh4Q9D8F1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alkbh4Q9D8F1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alkbh4Q9D8F1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alkbh4Q9D8F1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alkbh4Q9D8F1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.2 ms