Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C3

Alg13, Putative bifunctional UDP-N-acetylglucosamine transferase and deubiquitinase ALG13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg13Q9D8C3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Alg13Q9D8C3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Alg13Q9D8C3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Alg13Q9D8C3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Alg13Q9D8C3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Alg13Q9D8C3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Alg13Q9D8C3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Alg13Q9D8C3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Alg13Q9D8C3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Alg13Q9D8C3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Alg13Q9D8C3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Alg13Q9D8C3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Alg13Q9D8C3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Alg13Q9D8C3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Alg13Q9D8C3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Alg13Q9D8C3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Alg13Q9D8C3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Alg13Q9D8C3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Alg13Q9D8C3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Alg13Q9D8C3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Alg13Q9D8C3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Alg13Q9D8C3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Alg13Q9D8C3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Alg13Q9D8C3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Alg13Q9D8C3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Alg13Q9D8C3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Alg13Q9D8C3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Alg13Q9D8C3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Alg13Q9D8C3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Alg13Q9D8C3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Alg13Q9D8C3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Alg13Q9D8C3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Alg13Q9D8C3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Alg13Q9D8C3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Alg13Q9D8C3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Alg13Q9D8C3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Alg13Q9D8C3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Alg13Q9D8C3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Alg13Q9D8C3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Alg13Q9D8C3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Alg13Q9D8C3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Alg13Q9D8C3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Alg13Q9D8C3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Alg13Q9D8C3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Alg13Q9D8C3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Alg13Q9D8C3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Alg13Q9D8C3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Alg13Q9D8C3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Alg13Q9D8C3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Alg13Q9D8C3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Alg13Q9D8C3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Alg13Q9D8C3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Alg13Q9D8C3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Alg13Q9D8C3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Alg13Q9D8C3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Alg13Q9D8C3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Alg13Q9D8C3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Alg13Q9D8C3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Alg13Q9D8C3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Alg13Q9D8C3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Alg13Q9D8C3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Alg13Q9D8C3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Alg13Q9D8C3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Alg13Q9D8C3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Alg13Q9D8C3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Alg13Q9D8C3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Alg13Q9D8C3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Alg13Q9D8C3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Alg13Q9D8C3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Alg13Q9D8C3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Alg13Q9D8C3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Alg13Q9D8C3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Alg13Q9D8C3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Alg13Q9D8C3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Alg13Q9D8C3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Alg13Q9D8C3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Alg13Q9D8C3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Alg13Q9D8C3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Alg13Q9D8C3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Alg13Q9D8C3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Alg13Q9D8C3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Alg13Q9D8C3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Alg13Q9D8C3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Alg13Q9D8C3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Alg13Q9D8C3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Alg13Q9D8C3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Alg13Q9D8C3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Alg13Q9D8C3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Alg13Q9D8C3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Alg13Q9D8C3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Alg13Q9D8C3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Alg13Q9D8C3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Alg13Q9D8C3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Alg13Q9D8C3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Alg13Q9D8C3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Alg13Q9D8C3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Alg13Q9D8C3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Alg13Q9D8C3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Alg13Q9D8C3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Alg13Q9D8C3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms