Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
2310002L09RikQ9D7L5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
2310002L09RikQ9D7L5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
2310002L09RikQ9D7L5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
2310002L09RikQ9D7L5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
2310002L09RikQ9D7L5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
2310002L09RikQ9D7L5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
2310002L09RikQ9D7L5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
2310002L09RikQ9D7L5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
2310002L09RikQ9D7L5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
2310002L09RikQ9D7L5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
2310002L09RikQ9D7L5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
2310002L09RikQ9D7L5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
2310002L09RikQ9D7L5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
2310002L09RikQ9D7L5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
2310002L09RikQ9D7L5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
2310002L09RikQ9D7L5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
2310002L09RikQ9D7L5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
2310002L09RikQ9D7L5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
2310002L09RikQ9D7L5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
2310002L09RikQ9D7L5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
2310002L09RikQ9D7L5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
2310002L09RikQ9D7L5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
2310002L09RikQ9D7L5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
2310002L09RikQ9D7L5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
2310002L09RikQ9D7L5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
2310002L09RikQ9D7L5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
2310002L09RikQ9D7L5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
2310002L09RikQ9D7L5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
2310002L09RikQ9D7L5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
2310002L09RikQ9D7L5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
2310002L09RikQ9D7L5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
2310002L09RikQ9D7L5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
2310002L09RikQ9D7L5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
2310002L09RikQ9D7L5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
2310002L09RikQ9D7L5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
2310002L09RikQ9D7L5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
2310002L09RikQ9D7L5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
2310002L09RikQ9D7L5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
2310002L09RikQ9D7L5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
2310002L09RikQ9D7L5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
2310002L09RikQ9D7L5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
2310002L09RikQ9D7L5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
2310002L09RikQ9D7L5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
2310002L09RikQ9D7L5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
2310002L09RikQ9D7L5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
2310002L09RikQ9D7L5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
2310002L09RikQ9D7L5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
2310002L09RikQ9D7L5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
2310002L09RikQ9D7L5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
2310002L09RikQ9D7L5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
2310002L09RikQ9D7L5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
2310002L09RikQ9D7L5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
2310002L09RikQ9D7L5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
2310002L09RikQ9D7L5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
2310002L09RikQ9D7L5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
2310002L09RikQ9D7L5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
2310002L09RikQ9D7L5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
2310002L09RikQ9D7L5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
2310002L09RikQ9D7L5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
2310002L09RikQ9D7L5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
2310002L09RikQ9D7L5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
2310002L09RikQ9D7L5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
2310002L09RikQ9D7L5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
2310002L09RikQ9D7L5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
2310002L09RikQ9D7L5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
2310002L09RikQ9D7L5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
2310002L09RikQ9D7L5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
2310002L09RikQ9D7L5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
2310002L09RikQ9D7L5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
2310002L09RikQ9D7L5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
2310002L09RikQ9D7L5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
2310002L09RikQ9D7L5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
2310002L09RikQ9D7L5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
2310002L09RikQ9D7L5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
2310002L09RikQ9D7L5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
2310002L09RikQ9D7L5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
2310002L09RikQ9D7L5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
2310002L09RikQ9D7L5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
2310002L09RikQ9D7L5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
2310002L09RikQ9D7L5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
2310002L09RikQ9D7L5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
2310002L09RikQ9D7L5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
2310002L09RikQ9D7L5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
2310002L09RikQ9D7L5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
2310002L09RikQ9D7L5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
2310002L09RikQ9D7L5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
2310002L09RikQ9D7L5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
2310002L09RikQ9D7L5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
2310002L09RikQ9D7L5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
2310002L09RikQ9D7L5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
2310002L09RikQ9D7L5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
2310002L09RikQ9D7L5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
2310002L09RikQ9D7L5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
2310002L09RikQ9D7L5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
2310002L09RikQ9D7L5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
2310002L09RikQ9D7L5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
2310002L09RikQ9D7L5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms