Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab11fip1Q9D620 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab11fip1Q9D620 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab11fip1Q9D620 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab11fip1Q9D620 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab11fip1Q9D620 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab11fip1Q9D620 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab11fip1Q9D620 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab11fip1Q9D620 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab11fip1Q9D620 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab11fip1Q9D620 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab11fip1Q9D620 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab11fip1Q9D620 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab11fip1Q9D620 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rab11fip1Q9D620 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rab11fip1Q9D620 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rab11fip1Q9D620 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab11fip1Q9D620 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab11fip1Q9D620 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab11fip1Q9D620 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab11fip1Q9D620 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab11fip1Q9D620 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab11fip1Q9D620 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab11fip1Q9D620 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab11fip1Q9D620 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab11fip1Q9D620 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rab11fip1Q9D620 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rab11fip1Q9D620 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rab11fip1Q9D620 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rab11fip1Q9D620 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab11fip1Q9D620 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rab11fip1Q9D620 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rab11fip1Q9D620 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rab11fip1Q9D620 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rab11fip1Q9D620 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rab11fip1Q9D620 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rab11fip1Q9D620 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab11fip1Q9D620 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab11fip1Q9D620 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab11fip1Q9D620 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab11fip1Q9D620 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab11fip1Q9D620 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab11fip1Q9D620 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab11fip1Q9D620 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab11fip1Q9D620 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab11fip1Q9D620 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab11fip1Q9D620 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab11fip1Q9D620 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab11fip1Q9D620 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab11fip1Q9D620 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab11fip1Q9D620 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab11fip1Q9D620 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip1Q9D620 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip1Q9D620 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab11fip1Q9D620 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab11fip1Q9D620 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab11fip1Q9D620 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab11fip1Q9D620 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab11fip1Q9D620 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab11fip1Q9D620 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab11fip1Q9D620 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip1Q9D620 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip1Q9D620 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip1Q9D620 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip1Q9D620 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip1Q9D620 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rab11fip1Q9D620 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab11fip1Q9D620 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab11fip1Q9D620 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab11fip1Q9D620 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab11fip1Q9D620 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab11fip1Q9D620 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip1Q9D620 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms