Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5R4

Spata1, Spermatogenesis-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata1Q9D5R4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spata1Q9D5R4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spata1Q9D5R4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spata1Q9D5R4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spata1Q9D5R4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spata1Q9D5R4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spata1Q9D5R4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spata1Q9D5R4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spata1Q9D5R4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spata1Q9D5R4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spata1Q9D5R4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spata1Q9D5R4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spata1Q9D5R4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spata1Q9D5R4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spata1Q9D5R4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spata1Q9D5R4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spata1Q9D5R4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spata1Q9D5R4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Spata1Q9D5R4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Spata1Q9D5R4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spata1Q9D5R4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spata1Q9D5R4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spata1Q9D5R4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spata1Q9D5R4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spata1Q9D5R4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spata1Q9D5R4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spata1Q9D5R4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spata1Q9D5R4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spata1Q9D5R4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spata1Q9D5R4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spata1Q9D5R4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spata1Q9D5R4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spata1Q9D5R4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spata1Q9D5R4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spata1Q9D5R4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spata1Q9D5R4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spata1Q9D5R4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spata1Q9D5R4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spata1Q9D5R4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spata1Q9D5R4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spata1Q9D5R4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spata1Q9D5R4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spata1Q9D5R4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spata1Q9D5R4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spata1Q9D5R4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spata1Q9D5R4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spata1Q9D5R4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spata1Q9D5R4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spata1Q9D5R4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spata1Q9D5R4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Spata1Q9D5R4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spata1Q9D5R4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spata1Q9D5R4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms