Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam90a1bQ9D4F3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam90a1bQ9D4F3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam90a1bQ9D4F3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam90a1bQ9D4F3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam90a1bQ9D4F3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam90a1bQ9D4F3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam90a1bQ9D4F3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam90a1bQ9D4F3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam90a1bQ9D4F3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam90a1bQ9D4F3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam90a1bQ9D4F3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam90a1bQ9D4F3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam90a1bQ9D4F3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam90a1bQ9D4F3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam90a1bQ9D4F3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam90a1bQ9D4F3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam90a1bQ9D4F3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam90a1bQ9D4F3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam90a1bQ9D4F3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam90a1bQ9D4F3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam90a1bQ9D4F3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam90a1bQ9D4F3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam90a1bQ9D4F3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam90a1bQ9D4F3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam90a1bQ9D4F3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam90a1bQ9D4F3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam90a1bQ9D4F3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam90a1bQ9D4F3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam90a1bQ9D4F3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam90a1bQ9D4F3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam90a1bQ9D4F3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam90a1bQ9D4F3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam90a1bQ9D4F3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam90a1bQ9D4F3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam90a1bQ9D4F3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam90a1bQ9D4F3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam90a1bQ9D4F3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam90a1bQ9D4F3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam90a1bQ9D4F3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam90a1bQ9D4F3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam90a1bQ9D4F3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam90a1bQ9D4F3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam90a1bQ9D4F3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam90a1bQ9D4F3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam90a1bQ9D4F3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam90a1bQ9D4F3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam90a1bQ9D4F3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam90a1bQ9D4F3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam90a1bQ9D4F3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam90a1bQ9D4F3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam90a1bQ9D4F3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam90a1bQ9D4F3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam90a1bQ9D4F3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam90a1bQ9D4F3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam90a1bQ9D4F3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam90a1bQ9D4F3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam90a1bQ9D4F3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam90a1bQ9D4F3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam90a1bQ9D4F3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam90a1bQ9D4F3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam90a1bQ9D4F3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam90a1bQ9D4F3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam90a1bQ9D4F3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam90a1bQ9D4F3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam90a1bQ9D4F3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam90a1bQ9D4F3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam90a1bQ9D4F3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam90a1bQ9D4F3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam90a1bQ9D4F3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam90a1bQ9D4F3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam90a1bQ9D4F3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam90a1bQ9D4F3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam90a1bQ9D4F3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam90a1bQ9D4F3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam90a1bQ9D4F3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam90a1bQ9D4F3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam90a1bQ9D4F3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam90a1bQ9D4F3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam90a1bQ9D4F3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam90a1bQ9D4F3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam90a1bQ9D4F3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam90a1bQ9D4F3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam90a1bQ9D4F3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam90a1bQ9D4F3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam90a1bQ9D4F3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam90a1bQ9D4F3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam90a1bQ9D4F3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam90a1bQ9D4F3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam90a1bQ9D4F3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam90a1bQ9D4F3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam90a1bQ9D4F3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam90a1bQ9D4F3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms