Protein–RNA interactions for Protein: Q9D483

Polr3c, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3cQ9D483 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr3cQ9D483 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr3cQ9D483 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr3cQ9D483 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr3cQ9D483 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr3cQ9D483 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr3cQ9D483 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr3cQ9D483 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr3cQ9D483 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr3cQ9D483 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr3cQ9D483 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr3cQ9D483 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3cQ9D483 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr3cQ9D483 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3cQ9D483 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3cQ9D483 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr3cQ9D483 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3cQ9D483 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3cQ9D483 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3cQ9D483 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3cQ9D483 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr3cQ9D483 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3cQ9D483 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr3cQ9D483 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr3cQ9D483 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr3cQ9D483 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr3cQ9D483 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Polr3cQ9D483 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr3cQ9D483 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr3cQ9D483 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr3cQ9D483 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr3cQ9D483 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr3cQ9D483 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr3cQ9D483 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr3cQ9D483 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr3cQ9D483 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr3cQ9D483 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr3cQ9D483 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr3cQ9D483 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr3cQ9D483 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr3cQ9D483 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr3cQ9D483 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr3cQ9D483 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr3cQ9D483 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr3cQ9D483 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr3cQ9D483 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr3cQ9D483 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr3cQ9D483 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr3cQ9D483 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr3cQ9D483 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr3cQ9D483 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr3cQ9D483 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr3cQ9D483 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr3cQ9D483 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr3cQ9D483 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3cQ9D483 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3cQ9D483 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3cQ9D483 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3cQ9D483 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3cQ9D483 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr3cQ9D483 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr3cQ9D483 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr3cQ9D483 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr3cQ9D483 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr3cQ9D483 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Polr3cQ9D483 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr3cQ9D483 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr3cQ9D483 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr3cQ9D483 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr3cQ9D483 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr3cQ9D483 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr3cQ9D483 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr3cQ9D483 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr3cQ9D483 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr3cQ9D483 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr3cQ9D483 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms