Protein–RNA interactions for Protein: Q9D443

4933415A04Rik, RIKEN cDNA 4933415A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933415A04RikQ9D443 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4933415A04RikQ9D443 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933415A04RikQ9D443 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933415A04RikQ9D443 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933415A04RikQ9D443 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933415A04RikQ9D443 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933415A04RikQ9D443 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933415A04RikQ9D443 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933415A04RikQ9D443 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4933415A04RikQ9D443 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
4933415A04RikQ9D443 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
4933415A04RikQ9D443 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
4933415A04RikQ9D443 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933415A04RikQ9D443 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
4933415A04RikQ9D443 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933415A04RikQ9D443 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933415A04RikQ9D443 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
4933415A04RikQ9D443 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4933415A04RikQ9D443 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933415A04RikQ9D443 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933415A04RikQ9D443 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4933415A04RikQ9D443 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms