Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D3J9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D3J9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D3J9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D3J9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D3J9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D3J9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D3J9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D3J9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D3J9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D3J9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D3J9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D3J9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D3J9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D3J9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D3J9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D3J9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D3J9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D3J9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D3J9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D3J9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D3J9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D3J9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D3J9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D3J9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D3J9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D3J9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D3J9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D3J9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D3J9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D3J9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D3J9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Q9D3J9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D3J9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D3J9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D3J9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D3J9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D3J9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D3J9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D3J9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9D3J9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9D3J9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9D3J9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9D3J9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9D3J9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D3J9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D3J9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D3J9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D3J9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D3J9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D3J9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D3J9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9D3J9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D3J9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D3J9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D3J9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D3J9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D3J9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D3J9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D3J9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D3J9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D3J9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D3J9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D3J9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D3J9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D3J9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9D3J9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D3J9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D3J9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D3J9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D3J9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D3J9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D3J9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D3J9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D3J9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D3J9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D3J9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D3J9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms