Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snrnp35Q9D384 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Snrnp35Q9D384 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snrnp35Q9D384 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snrnp35Q9D384 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snrnp35Q9D384 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snrnp35Q9D384 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snrnp35Q9D384 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snrnp35Q9D384 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snrnp35Q9D384 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snrnp35Q9D384 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snrnp35Q9D384 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snrnp35Q9D384 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snrnp35Q9D384 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snrnp35Q9D384 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snrnp35Q9D384 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Snrnp35Q9D384 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snrnp35Q9D384 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snrnp35Q9D384 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snrnp35Q9D384 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snrnp35Q9D384 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snrnp35Q9D384 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snrnp35Q9D384 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snrnp35Q9D384 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snrnp35Q9D384 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Snrnp35Q9D384 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snrnp35Q9D384 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snrnp35Q9D384 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snrnp35Q9D384 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snrnp35Q9D384 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snrnp35Q9D384 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snrnp35Q9D384 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snrnp35Q9D384 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snrnp35Q9D384 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snrnp35Q9D384 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snrnp35Q9D384 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snrnp35Q9D384 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snrnp35Q9D384 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snrnp35Q9D384 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Snrnp35Q9D384 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snrnp35Q9D384 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snrnp35Q9D384 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snrnp35Q9D384 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snrnp35Q9D384 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snrnp35Q9D384 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Snrnp35Q9D384 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snrnp35Q9D384 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snrnp35Q9D384 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snrnp35Q9D384 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snrnp35Q9D384 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Snrnp35Q9D384 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snrnp35Q9D384 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Snrnp35Q9D384 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snrnp35Q9D384 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snrnp35Q9D384 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snrnp35Q9D384 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snrnp35Q9D384 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snrnp35Q9D384 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snrnp35Q9D384 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snrnp35Q9D384 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snrnp35Q9D384 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snrnp35Q9D384 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snrnp35Q9D384 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snrnp35Q9D384 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snrnp35Q9D384 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snrnp35Q9D384 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snrnp35Q9D384 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snrnp35Q9D384 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snrnp35Q9D384 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Snrnp35Q9D384 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snrnp35Q9D384 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snrnp35Q9D384 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snrnp35Q9D384 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snrnp35Q9D384 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snrnp35Q9D384 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snrnp35Q9D384 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Snrnp35Q9D384 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Snrnp35Q9D384 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snrnp35Q9D384 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snrnp35Q9D384 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snrnp35Q9D384 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snrnp35Q9D384 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snrnp35Q9D384 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snrnp35Q9D384 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snrnp35Q9D384 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snrnp35Q9D384 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snrnp35Q9D384 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snrnp35Q9D384 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snrnp35Q9D384 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snrnp35Q9D384 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snrnp35Q9D384 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snrnp35Q9D384 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snrnp35Q9D384 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snrnp35Q9D384 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snrnp35Q9D384 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snrnp35Q9D384 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snrnp35Q9D384 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snrnp35Q9D384 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snrnp35Q9D384 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snrnp35Q9D384 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms