Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D1K7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D1K7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D1K7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D1K7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D1K7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D1K7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D1K7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D1K7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D1K7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D1K7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D1K7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D1K7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D1K7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D1K7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D1K7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9D1K7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D1K7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D1K7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D1K7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D1K7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D1K7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D1K7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D1K7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D1K7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D1K7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D1K7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D1K7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D1K7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9D1K7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D1K7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D1K7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9D1K7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D1K7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9D1K7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D1K7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D1K7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D1K7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D1K7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Q9D1K7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D1K7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D1K7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D1K7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D1K7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D1K7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D1K7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D1K7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D1K7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D1K7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D1K7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D1K7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D1K7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms