Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl52Q9D0Y8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl52Q9D0Y8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms