Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lsm12Q9D0R8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lsm12Q9D0R8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lsm12Q9D0R8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lsm12Q9D0R8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lsm12Q9D0R8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lsm12Q9D0R8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lsm12Q9D0R8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lsm12Q9D0R8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lsm12Q9D0R8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lsm12Q9D0R8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lsm12Q9D0R8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lsm12Q9D0R8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lsm12Q9D0R8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lsm12Q9D0R8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lsm12Q9D0R8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lsm12Q9D0R8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lsm12Q9D0R8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lsm12Q9D0R8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lsm12Q9D0R8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lsm12Q9D0R8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lsm12Q9D0R8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lsm12Q9D0R8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lsm12Q9D0R8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lsm12Q9D0R8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lsm12Q9D0R8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lsm12Q9D0R8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lsm12Q9D0R8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lsm12Q9D0R8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lsm12Q9D0R8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lsm12Q9D0R8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lsm12Q9D0R8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lsm12Q9D0R8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lsm12Q9D0R8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lsm12Q9D0R8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lsm12Q9D0R8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lsm12Q9D0R8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lsm12Q9D0R8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lsm12Q9D0R8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lsm12Q9D0R8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lsm12Q9D0R8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lsm12Q9D0R8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lsm12Q9D0R8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lsm12Q9D0R8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lsm12Q9D0R8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lsm12Q9D0R8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lsm12Q9D0R8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lsm12Q9D0R8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lsm12Q9D0R8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lsm12Q9D0R8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lsm12Q9D0R8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lsm12Q9D0R8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lsm12Q9D0R8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lsm12Q9D0R8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lsm12Q9D0R8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lsm12Q9D0R8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lsm12Q9D0R8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lsm12Q9D0R8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.7 ms