Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Exosc7Q9D0M0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Exosc7Q9D0M0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Exosc7Q9D0M0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Exosc7Q9D0M0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Exosc7Q9D0M0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Exosc7Q9D0M0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Exosc7Q9D0M0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Exosc7Q9D0M0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Exosc7Q9D0M0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Exosc7Q9D0M0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Exosc7Q9D0M0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Exosc7Q9D0M0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Exosc7Q9D0M0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Exosc7Q9D0M0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Exosc7Q9D0M0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Exosc7Q9D0M0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Exosc7Q9D0M0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Exosc7Q9D0M0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Exosc7Q9D0M0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Exosc7Q9D0M0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Exosc7Q9D0M0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Exosc7Q9D0M0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Exosc7Q9D0M0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Exosc7Q9D0M0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Exosc7Q9D0M0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Exosc7Q9D0M0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Exosc7Q9D0M0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Exosc7Q9D0M0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Exosc7Q9D0M0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Exosc7Q9D0M0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Exosc7Q9D0M0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Exosc7Q9D0M0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Exosc7Q9D0M0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Exosc7Q9D0M0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Exosc7Q9D0M0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Exosc7Q9D0M0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Exosc7Q9D0M0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Exosc7Q9D0M0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Exosc7Q9D0M0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Exosc7Q9D0M0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Exosc7Q9D0M0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exosc7Q9D0M0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exosc7Q9D0M0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exosc7Q9D0M0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exosc7Q9D0M0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exosc7Q9D0M0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exosc7Q9D0M0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exosc7Q9D0M0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Exosc7Q9D0M0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exosc7Q9D0M0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Exosc7Q9D0M0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exosc7Q9D0M0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exosc7Q9D0M0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exosc7Q9D0M0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exosc7Q9D0M0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exosc7Q9D0M0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Exosc7Q9D0M0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exosc7Q9D0M0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Exosc7Q9D0M0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exosc7Q9D0M0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exosc7Q9D0M0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exosc7Q9D0M0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exosc7Q9D0M0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exosc7Q9D0M0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Exosc7Q9D0M0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Exosc7Q9D0M0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Exosc7Q9D0M0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Exosc7Q9D0M0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Exosc7Q9D0M0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exosc7Q9D0M0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exosc7Q9D0M0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exosc7Q9D0M0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exosc7Q9D0M0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exosc7Q9D0M0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Exosc7Q9D0M0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Exosc7Q9D0M0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Exosc7Q9D0M0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Exosc7Q9D0M0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Exosc7Q9D0M0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Exosc7Q9D0M0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Exosc7Q9D0M0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Exosc7Q9D0M0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Exosc7Q9D0M0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Exosc7Q9D0M0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Exosc7Q9D0M0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Exosc7Q9D0M0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Exosc7Q9D0M0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Exosc7Q9D0M0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Exosc7Q9D0M0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Exosc7Q9D0M0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Exosc7Q9D0M0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Exosc7Q9D0M0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Exosc7Q9D0M0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Exosc7Q9D0M0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Exosc7Q9D0M0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Exosc7Q9D0M0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Exosc7Q9D0M0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Exosc7Q9D0M0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Exosc7Q9D0M0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms