Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc77Q9CZH8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc77Q9CZH8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc77Q9CZH8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc77Q9CZH8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc77Q9CZH8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc77Q9CZH8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc77Q9CZH8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc77Q9CZH8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc77Q9CZH8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc77Q9CZH8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc77Q9CZH8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc77Q9CZH8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc77Q9CZH8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc77Q9CZH8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc77Q9CZH8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc77Q9CZH8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc77Q9CZH8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc77Q9CZH8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc77Q9CZH8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc77Q9CZH8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc77Q9CZH8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc77Q9CZH8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc77Q9CZH8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc77Q9CZH8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc77Q9CZH8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc77Q9CZH8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc77Q9CZH8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc77Q9CZH8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc77Q9CZH8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc77Q9CZH8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc77Q9CZH8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc77Q9CZH8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc77Q9CZH8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc77Q9CZH8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc77Q9CZH8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc77Q9CZH8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc77Q9CZH8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc77Q9CZH8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc77Q9CZH8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc77Q9CZH8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc77Q9CZH8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc77Q9CZH8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc77Q9CZH8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc77Q9CZH8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc77Q9CZH8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc77Q9CZH8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc77Q9CZH8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc77Q9CZH8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc77Q9CZH8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc77Q9CZH8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc77Q9CZH8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc77Q9CZH8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc77Q9CZH8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc77Q9CZH8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc77Q9CZH8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc77Q9CZH8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc77Q9CZH8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc77Q9CZH8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc77Q9CZH8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc77Q9CZH8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc77Q9CZH8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc77Q9CZH8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc77Q9CZH8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc77Q9CZH8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc77Q9CZH8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc77Q9CZH8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc77Q9CZH8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc77Q9CZH8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc77Q9CZH8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc77Q9CZH8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc77Q9CZH8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc77Q9CZH8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc77Q9CZH8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc77Q9CZH8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms