Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl35Q9CZ49 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl35Q9CZ49 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhl35Q9CZ49 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhl35Q9CZ49 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhl35Q9CZ49 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Klhl35Q9CZ49 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Klhl35Q9CZ49 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhl35Q9CZ49 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhl35Q9CZ49 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhl35Q9CZ49 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klhl35Q9CZ49 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klhl35Q9CZ49 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klhl35Q9CZ49 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klhl35Q9CZ49 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klhl35Q9CZ49 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Klhl35Q9CZ49 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klhl35Q9CZ49 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Klhl35Q9CZ49 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Klhl35Q9CZ49 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl35Q9CZ49 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl35Q9CZ49 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl35Q9CZ49 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klhl35Q9CZ49 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl35Q9CZ49 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klhl35Q9CZ49 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl35Q9CZ49 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl35Q9CZ49 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl35Q9CZ49 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl35Q9CZ49 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klhl35Q9CZ49 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl35Q9CZ49 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl35Q9CZ49 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl35Q9CZ49 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl35Q9CZ49 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhl35Q9CZ49 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl35Q9CZ49 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhl35Q9CZ49 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl35Q9CZ49 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhl35Q9CZ49 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl35Q9CZ49 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl35Q9CZ49 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhl35Q9CZ49 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhl35Q9CZ49 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl35Q9CZ49 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl35Q9CZ49 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhl35Q9CZ49 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl35Q9CZ49 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl35Q9CZ49 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhl35Q9CZ49 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl35Q9CZ49 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl35Q9CZ49 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl35Q9CZ49 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl35Q9CZ49 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl35Q9CZ49 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhl35Q9CZ49 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klhl35Q9CZ49 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhl35Q9CZ49 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhl35Q9CZ49 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhl35Q9CZ49 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhl35Q9CZ49 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhl35Q9CZ49 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhl35Q9CZ49 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhl35Q9CZ49 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhl35Q9CZ49 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhl35Q9CZ49 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl35Q9CZ49 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl35Q9CZ49 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl35Q9CZ49 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl35Q9CZ49 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhl35Q9CZ49 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klhl35Q9CZ49 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klhl35Q9CZ49 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klhl35Q9CZ49 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhl35Q9CZ49 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Klhl35Q9CZ49 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klhl35Q9CZ49 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms