Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXG9

Phf19, PHD finger protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf19Q9CXG9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf19Q9CXG9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phf19Q9CXG9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf19Q9CXG9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf19Q9CXG9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf19Q9CXG9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf19Q9CXG9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf19Q9CXG9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf19Q9CXG9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf19Q9CXG9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf19Q9CXG9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf19Q9CXG9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf19Q9CXG9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf19Q9CXG9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf19Q9CXG9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phf19Q9CXG9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf19Q9CXG9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf19Q9CXG9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf19Q9CXG9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf19Q9CXG9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Phf19Q9CXG9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf19Q9CXG9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phf19Q9CXG9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf19Q9CXG9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Phf19Q9CXG9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf19Q9CXG9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Phf19Q9CXG9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf19Q9CXG9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Phf19Q9CXG9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf19Q9CXG9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf19Q9CXG9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phf19Q9CXG9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phf19Q9CXG9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Phf19Q9CXG9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf19Q9CXG9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf19Q9CXG9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Phf19Q9CXG9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf19Q9CXG9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf19Q9CXG9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Phf19Q9CXG9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf19Q9CXG9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf19Q9CXG9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Phf19Q9CXG9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Phf19Q9CXG9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf19Q9CXG9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Phf19Q9CXG9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf19Q9CXG9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf19Q9CXG9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Phf19Q9CXG9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf19Q9CXG9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf19Q9CXG9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Phf19Q9CXG9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf19Q9CXG9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf19Q9CXG9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf19Q9CXG9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf19Q9CXG9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf19Q9CXG9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf19Q9CXG9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf19Q9CXG9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf19Q9CXG9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf19Q9CXG9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf19Q9CXG9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf19Q9CXG9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf19Q9CXG9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf19Q9CXG9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf19Q9CXG9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf19Q9CXG9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf19Q9CXG9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf19Q9CXG9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf19Q9CXG9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf19Q9CXG9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf19Q9CXG9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf19Q9CXG9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf19Q9CXG9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf19Q9CXG9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf19Q9CXG9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf19Q9CXG9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms