Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmed5Q9CXE7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmed5Q9CXE7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmed5Q9CXE7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmed5Q9CXE7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmed5Q9CXE7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed5Q9CXE7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmed5Q9CXE7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmed5Q9CXE7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmed5Q9CXE7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmed5Q9CXE7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmed5Q9CXE7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmed5Q9CXE7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmed5Q9CXE7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmed5Q9CXE7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmed5Q9CXE7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmed5Q9CXE7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmed5Q9CXE7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmed5Q9CXE7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmed5Q9CXE7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmed5Q9CXE7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmed5Q9CXE7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmed5Q9CXE7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmed5Q9CXE7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmed5Q9CXE7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms