Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc3Q9CXE6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Xrcc3Q9CXE6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc3Q9CXE6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc3Q9CXE6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc3Q9CXE6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Xrcc3Q9CXE6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xrcc3Q9CXE6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xrcc3Q9CXE6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Xrcc3Q9CXE6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xrcc3Q9CXE6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xrcc3Q9CXE6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Xrcc3Q9CXE6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Xrcc3Q9CXE6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xrcc3Q9CXE6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Xrcc3Q9CXE6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xrcc3Q9CXE6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Xrcc3Q9CXE6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xrcc3Q9CXE6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Xrcc3Q9CXE6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xrcc3Q9CXE6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xrcc3Q9CXE6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Xrcc3Q9CXE6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xrcc3Q9CXE6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Xrcc3Q9CXE6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Xrcc3Q9CXE6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Xrcc3Q9CXE6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Xrcc3Q9CXE6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Xrcc3Q9CXE6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Xrcc3Q9CXE6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Xrcc3Q9CXE6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Xrcc3Q9CXE6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Xrcc3Q9CXE6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Xrcc3Q9CXE6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Xrcc3Q9CXE6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Xrcc3Q9CXE6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Xrcc3Q9CXE6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Xrcc3Q9CXE6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Xrcc3Q9CXE6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Xrcc3Q9CXE6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Xrcc3Q9CXE6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Xrcc3Q9CXE6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Xrcc3Q9CXE6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Xrcc3Q9CXE6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms