Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubb2bQ9CWF2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tubb2bQ9CWF2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tubb2bQ9CWF2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tubb2bQ9CWF2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb2bQ9CWF2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb2bQ9CWF2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb2bQ9CWF2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb2bQ9CWF2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb2bQ9CWF2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb2bQ9CWF2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tubb2bQ9CWF2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tubb2bQ9CWF2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubb2bQ9CWF2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubb2bQ9CWF2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubb2bQ9CWF2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubb2bQ9CWF2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubb2bQ9CWF2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubb2bQ9CWF2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubb2bQ9CWF2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tubb2bQ9CWF2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubb2bQ9CWF2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubb2bQ9CWF2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubb2bQ9CWF2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubb2bQ9CWF2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubb2bQ9CWF2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubb2bQ9CWF2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubb2bQ9CWF2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubb2bQ9CWF2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubb2bQ9CWF2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubb2bQ9CWF2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubb2bQ9CWF2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubb2bQ9CWF2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubb2bQ9CWF2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubb2bQ9CWF2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubb2bQ9CWF2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubb2bQ9CWF2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubb2bQ9CWF2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubb2bQ9CWF2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubb2bQ9CWF2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubb2bQ9CWF2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubb2bQ9CWF2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubb2bQ9CWF2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubb2bQ9CWF2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubb2bQ9CWF2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubb2bQ9CWF2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubb2bQ9CWF2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubb2bQ9CWF2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubb2bQ9CWF2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubb2bQ9CWF2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubb2bQ9CWF2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tubb2bQ9CWF2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tubb2bQ9CWF2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubb2bQ9CWF2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubb2bQ9CWF2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tubb2bQ9CWF2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubb2bQ9CWF2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubb2bQ9CWF2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubb2bQ9CWF2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubb2bQ9CWF2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubb2bQ9CWF2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubb2bQ9CWF2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubb2bQ9CWF2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubb2bQ9CWF2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubb2bQ9CWF2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubb2bQ9CWF2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubb2bQ9CWF2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubb2bQ9CWF2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubb2bQ9CWF2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubb2bQ9CWF2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubb2bQ9CWF2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubb2bQ9CWF2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubb2bQ9CWF2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubb2bQ9CWF2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubb2bQ9CWF2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubb2bQ9CWF2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubb2bQ9CWF2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubb2bQ9CWF2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubb2bQ9CWF2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubb2bQ9CWF2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubb2bQ9CWF2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubb2bQ9CWF2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubb2bQ9CWF2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tubb2bQ9CWF2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tubb2bQ9CWF2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubb2bQ9CWF2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubb2bQ9CWF2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubb2bQ9CWF2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubb2bQ9CWF2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubb2bQ9CWF2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tubb2bQ9CWF2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tubb2bQ9CWF2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tubb2bQ9CWF2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tubb2bQ9CWF2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubb2bQ9CWF2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubb2bQ9CWF2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubb2bQ9CWF2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tubb2bQ9CWF2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tubb2bQ9CWF2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tubb2bQ9CWF2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms